Proteomic Technologies
蛋白质组学技术

虽然所涉及的潜在分子机制仍不清楚，但高通量转录组学、表观基因组学和蛋白质组学技术的最新进展促进了重大进展。

目的利用质谱和蛋白质组学技术探索小胶质细胞响应癌细胞释放的抗炎细胞因子而激活的肿瘤支持生物学过程。

使用蛋白质组学技术来表征和研究分枝杆菌的蛋白质组为分枝杆菌属的功能、多样性、蛋白质-蛋白质相互作用和宿主-病原体相互作用提供了重要信息。

蛋白质组学技术的最新进展使得在大型流行病学队列中对低丰度蛋白质进行高通量分析变得越来越可行。

虽然所涉及的潜在分子机制仍不清楚，但高通量转录组学、表观基因组学和蛋白质组学技术的最新进展促进了重大进展。

然而，最近出现的高含量单细胞转录组学和蛋白质组学技术大大提高了我们对手术免疫反应进行表征的能力，从而为了解术后并发症的免疫学基础和识别预后生物学特征提供了新的方法。

我们通过在卵巢癌肿瘤中鉴定蛋白质及其翻译后修饰来强调蛋白质组学技术现在在疾病的这两个方面发挥的作用。

近年来，已经开发了几种化学蛋白质组学技术，通过它们对亲电子探针的固有反应性来挖掘化学上可接近的残基。

具体来说，我们讨论了（1）基于质谱的结构技术如何克服限制并补充传统的结构方法，以了解 SARS-CoV-2 蛋白、复合物和病毒粒子的动态结构； (2) 病毒-宿主蛋白-蛋白相互作用作图可以识别 SARS-CoV-2 复制所需的细胞机制； (3) 全球蛋白质丰度和翻译后修饰分析可以表征在感染期间重新连接的信号通路； (4) 蛋白质组学技术可以帮助生物标志物鉴定、诊断和药物开发，以监测 COVID-19 病理学和研究治疗策略。

随着多重成像和空间转录组学和蛋白质组学技术的最新进展，细胞分割正在成为生物医学图像分析的关键步骤。

客观的 使用蛋白质组学技术筛选非酒精性脂肪性肝炎 (NASH) 患者肝组织中的差异表达蛋白 (DSP)，以确定 NASH 的潜在治疗靶点。

目的利用质谱和蛋白质组学技术探索小胶质细胞响应癌细胞释放的抗炎细胞因子而激活的肿瘤支持生物学过程。

用于鉴定和表征蛋白质聚糖的糖蛋白组学技术的出现有可能使人们更好地了解糖基化在生物学、疾病状态和其他感兴趣的领域中的作用。

尽管产生纤维素体的生物相对较少，但新的基因组和蛋白质组学技术的发展已经允许鉴定许多古细菌、细菌甚至一些原始真核生物中的纤维素体成分。

在此，我们使用基于质谱的蛋白质组学技术，系统地研究了 AMPK 在 DNA 损伤反应 (DDR) 中的调控网络。

然而，我们完全理解，在转录组学和蛋白质组学技术以及算法开发方面还需要更多创新，以实现对真核基因组进行高精度注释的目标。

为了全面了解随着营养品和疾病而变化的基因和蛋白质之间复杂的相互关系，基因组和蛋白质组学技术正在迅速发展成为营养品研究中使用的首选生物分析技术。

在这里，我们回顾了蛋白质组学技术、质谱仪器和生物信息学的最新进展如何通过测量 PTM 位点来促进蛋白质组范围内的 PTM 串扰识别。

基于质谱 (MS) 的蛋白质组学技术已经进步，可以对细胞和组织中的无数蛋白质进行全面的定性和定量蛋白质组分析。

接收日期：2021 年 2 月 12 日 / 接受日期：2021 年 2 月 15 日 基因组、转录组和蛋白质组技术的最新进展已经允许对正常和恶性血液干细胞和祖细胞中涉及的分子进行相当全面的定位。

随着过去 10 年蛋白质组学技术的指数级改进，大量的 PTMs 被发现在伴侣蛋白上，包括磷酸化、乙酰化、甲基化、SUMO 化和泛素化。

使用 Mann-Whitney 检验比较免疫组织化学和蛋白质组学技术。

尽管蛋白质组学技术取得了进步，但血浆生物标志物的临床转化率仍然很低，部分原因是候选生物标志物的发现与下游昂贵的临床验证研究之间存在主要瓶颈。

空间转录组学和蛋白质组学技术为研究原生微环境中的细胞提供了新的机会。

蛋白质组学技术与使用各种版本的质谱法已在开发用于诊断冠状病毒感染的新方法中得到应用。

整个过程需要几年时间才能完成，最近的基因组和蛋白质组学技术正在大量研究中确定涉及息肉转化为癌的每个步骤的几个目标。

我们在此重点介绍基于 MS 的 O-连接糖蛋白组学技术、定量数据采集策略和生物信息学工具的最新发展，特别关注粘蛋白型 O-连接糖基化。

这些糖蛋白组学技术具有广泛的应用，包括探索蛋白质糖基化的分子机制和发现人类疾病的新生物标志物。

因此，使用冗余、经济且需要最少样本量进行实时评估的蛋白质组学技术监测患者的全身细胞因子水平可能有助于更好地临床评估和管理危重病患者。

蛋白质组学技术的最新进展表明，包括 lncRNA 在内的大量非编码基因被错误注释，实际上编码蛋白质。

以基因组学为基础的蛋白质组学能够对特定细胞类型、组织和生物体中表达的蛋白质进行全局表征，并使用先进的基于高通量质谱的蛋白质组学技术为深入了解宿主-寄生虫界面提供关键。

转录组学和蛋白质组学技术以及来自单个囊肿的全基因组测序 (WGS) 的使用允许组装 G 的组合 C 和 D 的基因组序列草图。

蛋白质组学技术现在可以对遗传多样性样本中的数千种蛋白质进行快速定量。

在这项研究中，分离了感染或未感染 GCRV 的 Ctenopharyngodon idellus 肾 (CIK) 细胞分泌的外泌体，并通过蛋白质组学技术分析了差异蛋白表达谱。

肝片吸虫基因组的可用性，以及利用转录组学和蛋白质组学技术来探测寄生虫的生长和发育，启发了我们对组织蛋白酶样半胱氨酸肽酶的理解。

本综述旨在首先简要介绍可成功应用于精子和 SP 蛋白质组学分析的蛋白质组学技术和工作流程。

小麦基因组数据库以及转录组学和蛋白质组学技术的快速发展拓宽了我们在转录组和转录后水平上理解 PHS 抗性调控机制的知识。

随着高通量基因组学和蛋白质组学技术的出现，我们现在有机会以全新的视角观察这些疾病，这将提供对指导我们最终解决这些疾病至关重要的主要和次要事件的清晰理解新的治疗策略可能一起治疗这些疾病。

这篇综述将介绍计算和蛋白质组学技术的最新发展，这些技术允许对不同肿瘤类型和微环境生态位的 ECM 进行全面表征。

摘要蛋白质组学技术正在迅速改进和发展。

i) 这种差异的原因，(ii) 蛋白质组学技术如何克服似乎限制其转化为临床的技术挑战，以及 (iii) 讨论了 MS 如何在未来改进、补充或替代现有的临床上重要的检测方法.

在这十年中，使用高通量基因组、转录组和蛋白质组技术的大量信息已经在软体动物群的各个类别中产生，预计基础和应用研究将从这一资源中显着受益。

为了识别参与这些过程的特定蛋白质，我们使用了蛋白质组学技术。

本文介绍了有关蛋白质组学分析的当前文献以及蛋白质组学技术在诊断各种妇产科疾病中的作用。

基于电泳的磷酸化蛋白质组学技术的进步，例如固定化金属亲和层析 (IMAC) 后的二维差异凝胶电泳 (2D-DIGE) 和磷酸盐亲和性 Phos-tag PAGE，已经实现了对蛋白激酶底物的高效和详细分析。

所有这些会议都吸引了涉及基因组测序、微生物功能基因组学以及基因组和蛋白质组学技术的领先科学家和机构。

在这里，我们回顾了基于 MS 的定量蛋白质组学技术，这些技术对理解蛋白质组调控在发育过程中的作用做出了重大贡献。

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为了进一步提高我们对蛋白质和固体表面之间界面处蛋白质吸附/解吸动力学的了解，已经探索了蛋白质组学技术以确定表面上吸附的蛋白质与随后的生物反应之间的关系。

在过去的二十年里，高通量基因组学和蛋白质组学技术的进步已经产生了大量证据，证明许多疾病实际上是显着异质的，包括多个临床和分子上不同的亚型，它们只是共享一个解剖位置。

据我们所知，这是第一个结合转录组学和蛋白质组学技术来研究 Sc131 在乙醇胁迫下的机制的综合分析。

在过去的 20 年中，蛋白质组学技术得到了显着改进，这得益于增强的样品制备方案以及基于质谱的蛋白质鉴定和定量、数据库搜索和生物信息学分析能力的提高。

目前的蛋白质组学技术可以在一次实验中识别疾病和对照样本之间的数百种差异表达的蛋白质；然而，为进一步验证研究选择有希望的生物标志物候选者仍然很困难。

最后，我们探讨了 EC 生物标志物研究的新观点，包括对先前建议的候选生物标志物的全面了解，以及尚未应用于 EC 研究的基于质谱的新型蛋白质组学技术，这些技术具有更高的灵敏度和特异性，从而使研究设计具有直接的临床视角.

此外，生物流体和组织中蛋白质组学技术的快速发展提供了一种新的多标志物组合，从而导致发现更敏感的生物标志物。

C-HPP 的主要瓶颈之一是蛋白质组技术的敏感性不足，阻碍了对构成人类蛋白质组“黑暗部分”的低拷贝数和超低拷贝数蛋白质的检测。

蛋白质组学技术的最新进展显着增加了其他植物的蛋白质组覆盖率，可用于克服当前大豆种子蛋白质组学的复杂性和局限性。

存在许多涵盖专业学科和数据分析步骤的方法管道，可以肯定的是，未来几年将产生更多的数据分析方法，但它也强调了蛋白质组学技术在研究中的内在地位，以阐明生物过程的性质和对疾病病因的理解。

癌症药物开发依赖于蛋白质组学技术来识别潜在的生物标志物、作用机制并识别蛋白质结合热点。

此外，我们假设蛋白质组学技术的未来发展可能对改善我们对多能性的看法产生影响。

我们进行了系统的书目搜索，以确定调查蛋白质组学在 IBD 患者中的应用的研究，然后我们总结了蛋白质组学技术在 IBD 研究中应用的当前“最新技术”。