Single Cell Lineage(단세포 계통)란 무엇입니까?
Single Cell Lineage 단세포 계통 - Combining single-cell lineage tracing with RNA sequencing has provided unprecedented opportunities to prospectively explore metastatic dynamics in vivo. [1] There is no current method to combine single-cell lineage trees from different individuals ofthe same organism to reconstruct a single invariant lineage for the same species. [2] Wu and colleagues develop a barcoding tool, ClonMapper, which permits single-cell lineage tracing and clonal isolation and demonstrate its utility to study clonal dynamics in human CLL cells in the context of chemotherapy treatment and resistance. [3] In a comparison against seven state-of-the-art single-cell lineage tree reconstruction algorithms - BitPhylogeny, OncoNEM, SCITE, SiFit, SASC, SCIPhI, and SiCloneFit - on simulated and real single-cell tumor samples, Scelestial performed best at reconstructing trees in terms of accuracy and run time. [4] From the perspective of single-cell lineages, only one descendant is followed after each division, while in population snapshots all of the offspring is considered. [5] PURPOSE OF REVIEW In the last few decades, revolutionary advances in next-generation sequencing have led to single-cell lineage tracing technologies that now enable researchers to identify and quantify hematopoietic cell behavior with unprecedented detail. [6] RECENT FINDINGS Single-cell lineage tracing and functional validation studies have uncovered cell fate bias within transcriptionally distinct hematopoietic stem and progenitor subpopulations. [7] These advances allowed us to resolve deep and accurate single-cell lineages for tens of thousands of metastatically disseminated cancer cells in a mouse over 2 months of growth. [8] Single-cell lineage tracing and gene expression analysis reveal that the fate of Lgr6 stem cells is shifted toward differentiation following loss of their niche. [9] CONCLUSION intMEMOIR enables simultaneous analysis of single-cell lineage, gene expression, and spatial organization in the same tissue. [10] Single-cell lineage tracing provides crucial insights into the fates of individual cells. [11] Particularly in the context of stem cell biology, analysis of single cell lineages in their native state has elucidated novel fates and highlighted heterogeneity of function. [12]단일 세포 계통 추적과 RNA 시퀀싱을 결합하면 생체 내에서 전이 역학을 전향적으로 탐색할 수 있는 전례 없는 기회가 제공되었습니다. [1] 동일한 종에 대한 단일 불변 혈통을 재구성하기 위해 동일한 유기체의 다른 개체에서 단일 세포 혈통 트리를 결합하는 현재 방법은 없습니다. [2] Wu와 동료들은 단일 세포 계통 추적 및 클론 분리를 허용하고 화학 요법 치료 및 내성의 맥락에서 인간 CLL 세포의 클론 역학을 연구하는 유용성을 입증하는 바코드 도구인 ClonMapper를 개발했습니다. [3] 시뮬레이션 및 실제 단일 세포 종양 샘플에서 7가지 최신 단일 세포 계통 트리 재구성 알고리즘(BitPhylogeny, OncoNEM, SCITE, SiFit, SASC, SCIPhI 및 SiCloneFit)과 비교한 결과, Scelestial은 재구성에서 가장 우수한 성능을 보였습니다. 정확도와 실행 시간 면에서 트리. [4] 단세포 혈통의 관점에서 보면 각 분할 후 하나의 후손만 따르지만 인구 스냅샷에서는 모든 후손이 고려됩니다. [5] 검토 목적 지난 수십 년 동안 차세대 시퀀싱의 혁신적인 발전으로 단일 세포 계통 추적 기술이 발전하여 이제 연구자가 전례 없는 세부 사항으로 조혈 세포 행동을 식별하고 정량화할 수 있습니다. [6] 최근 발견 단일 세포 혈통 추적 및 기능 검증 연구는 전사적으로 구별되는 조혈 줄기 및 전구 하위 집단 내에서 세포 운명 편향을 밝혀냈습니다. [7] 이러한 발전을 통해 우리는 2개월 동안 성장한 마우스에서 수만 개의 전이성 암 세포에 대한 깊고 정확한 단일 세포 계통을 해결할 수 있었습니다. [8] 단일 세포 혈통 추적 및 유전자 발현 분석은 Lgr6 줄기 세포의 운명이 틈새 시장의 상실에 따라 분화를 향해 이동한다는 것을 보여줍니다. [9] 결론 intMEMOIR은 동일한 조직에서 단일 세포 계통, 유전자 발현 및 공간 조직의 동시 분석을 가능하게 합니다. [10] 단일 세포 계보 추적은 개별 세포의 운명에 대한 중요한 통찰력을 제공합니다. [11] 특히 줄기 세포 생물학의 맥락에서 고유 상태의 단일 세포 계통 분석은 새로운 운명을 밝히고 기능의 이질성을 강조했습니다. [12]