Sars Cov 2 Rna Dependent(Sars Cov 2 Rna 종속)란 무엇입니까?
Sars Cov 2 Rna Dependent Sars Cov 2 Rna 종속 - Use of this new framework to design potentially specific suramin analogs is exemplified using the SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase and nucleocapsid protein, identifying leads that might inhibit a wide range of coronaviruses. [1] In the absence of effective antiviral drugs, research of novel therapeutic targets such as SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) becomes essential. [2] Our data through cell-based and biochemical studies showed that both compounds act as SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) inhibitors directly and inhibit the activity of the SARS-CoV-2 RdRp, but baicalein was more potent. [3] Here we applied a virtual screening approach using Autodock Vina and molecular dynamics simulation in tandem to calculate binding energies for repurposed drugs against the SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). [4] Here we show that water-soluble derivatives of α-tocopherol have potent antiviral activity and synergize with remdesivir as inhibitors of the SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). [5] There are several already known drugs that through drug repositioning have shown an inhibitory activity against SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase. [6] This study aimed to evaluate the effect of biologically active compounds in the marine sponge on the SARS-CoV-2 RNA-dependent-RNA polymerase protein (RdRp) using the in-silico method. [7] Using AutoDock tools, the binding site, binding energy, inhibitory constant/K i and receptor-ligand interactions for each of the compounds were analyzed against SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). [8] Here we report that suramin, a 100-year-old drug, is a potent inhibitor of the SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) and acts by blocking the binding of RNA to the enzyme. [9] It is a nucleotide analogue inhibitor of the SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase; favipiravir is another member of the same class. [10] We applied HISNAPI to the case of SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase, a vital target of the antiviral drug for the treatment of coronavirus disease 2019. [11] 60 kcal/mol, respectively, with the SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase “RdRp”). [12] We applied it to the design of an electrochemiluminescent (ECL) biosensor to detect the SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) gene. [13] For a single-step hybridized reaction, the fabricated kit exhibited significant sensitivity (capacitance change, ΔC = ∼2 nF) in detecting the conserved region of the SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) gene with high sensitivity of 0. [14] In this study, several 2-((indol-3-yl)thio)-N-benzyl-acetamides were identified as SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) inhibitors. [15] The work is devoted to the study of the complementarity of the electronic structures of the ligands and SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase. [16] The catalytic subunit of SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) contains two active sites that catalyze nucleotidyl-monophosphate transfer (NMPylation). [17] Investigation of the underlying mode of action discloses that the sandacrabins inhibit the SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase complex, highlighting them as structurally distinct non-nucleoside RNA synthesis inhibitors. [18] From a select list of bioactive compounds extracted from the leaf of Spondias mombin with known antiviral properties, we identified Geraniin and 2-O-Caffeoyl-(+)-allohydroxycitric acid as potential SARS-CoV-2 inhibitors targeting SARS-CoV-2 RNA-dependent polymerase, the receptor-binding domain (RBD) of SARS-CoV-2 viral S-protein and the 3C-like main protease (3CLpro). [19] Here we present evidence that backtracking extends into the viral realm, where backtracking by the SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) may aid viral transcription and replication. [20] Currently, the SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp, encoded by nsp12-nsp7-nsp8) has been targeted by numerous inhibitors, e. [21] SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) protein is the target for the antiviral drug Remdesivir (RDV). [22] The nucleotide inhibitors such as sofosbuvir, ribavirin, galidesivir, remdesivir, favipiravir, cefuroxime, tenofovir, and hydroxychloroquine (HCHL), setrobuvir, YAK, and IDX-184 were found to be effective in binding to SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase. [23] Use of this new framework to design potentially specific suramin analogs is exemplified using the SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) and nucleocapsid protein, identifying leads that might inhibit a wide range of coronaviruses. [24] RESULTS We identified the siRNA, siR-7, targeting SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) as the most efficient siRNA inhibiting viral replication in vitro. [25] Promising potential results against SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) and methyltransferase (nsp16) are presented. [26] We illustrate the specific misunderstandings that have resulted from reductionist approaches to the study of SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp), which are but one instance of a regrettably growing trend in structural biology. [27] MATERIALS AND METHODS The crystal structures of SARS-CoV-2 main protein (Mpro) (PDB ID: 6Y2F) and SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) (PDB ID: 7BV2) both available from Protein Data Bank were used in the study. [28] ddhCTP has been shown to act as an obligate chain terminator of flavivirus and SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerases; however, further biophysical studies have been precluded by limited access to this promising antiviral. [29] The SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) is essential for virus replication, therefore it is a promising drug target. [30] Nsp12, the catalytic subunit of SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp), contains two active sites that catalyze nucleotidyl-monophosphate (NMP) transfer (NMPylation). [31] OBJECTIVE We studied phyto-compounds from Strychnos nux-vomica (a poisonous plant) against SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase by computational methods. [32] Currently, SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp, encoded by nsp12-nsp7-nsp8) has been targeted by numerous inhibitors with debated clinical impact. [33] The catalytic subunit of SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp), Nsp12, has a unique NiRAN domain that transfers nucleoside monophosphates to the Nsp9 protein. [34]잠재적으로 특정한 수라민 유사체를 설계하기 위한 이 새로운 프레임워크의 사용은 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 폴리머라제 및 뉴클레오캡시드 단백질을 사용하여 예시되어 광범위한 코로나바이러스를 억제할 수 있는 리드를 식별합니다. [1] 효과적인 항바이러스제가 없는 상황에서 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소(RdRp)와 같은 새로운 치료 표적에 대한 연구가 필수적입니다. [2] 세포 기반 및 생화학적 연구를 통한 우리의 데이터는 두 화합물이 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소(RdRp) 억제제로 직접 작용하고 SARS-CoV-2 RdRp의 활성을 억제하지만 바이칼레인이 더 강력하다는 것을 보여주었습니다. [3] 여기에서 우리는 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소(RdRp)에 대한 용도 변경 약물의 결합 에너지를 계산하기 위해 Autodock Vina와 분자 역학 시뮬레이션을 함께 사용하는 가상 스크리닝 접근 방식을 적용했습니다. [4] 여기에서 우리는 α-토코페롤의 수용성 유도체가 강력한 항바이러스 활성을 갖고 SARS-CoV-2 RNA-의존성 RNA 중합효소(RdRp)의 억제제로서 렘데시비르와 시너지 효과를 낸다는 것을 보여줍니다. [5] 약물 재배치를 통해 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 폴리머라제에 대한 억제 활성을 나타내는 몇 가지 이미 알려진 약물이 있습니다. [6] 이 연구는 in-silico 방법을 사용하여 SARS-CoV-2 RNA-의존성-RNA 중합효소 단백질(RdRp)에 대한 해양 해면의 생물학적 활성 화합물의 영향을 평가하는 것을 목표로 했습니다. [7] AutoDock 도구를 사용하여 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소(RdRp)에 대해 각 화합물에 대한 결합 부위, 결합 에너지, 억제 상수/Ki 및 수용체-리간드 상호작용을 분석했습니다. [8] 여기에서 우리는 100년 된 약물인 수라민이 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소(RdRp)의 강력한 억제제이며 RNA가 효소에 결합하는 것을 차단함으로써 작용한다고 보고합니다. [9] SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소의 뉴클레오티드 유사체 억제제입니다. favipiravir는 같은 클래스의 또 다른 구성원입니다. [10] 2019년 코로나바이러스 치료제 항바이러스제의 핵심 표적인 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소의 사례에 HISNAPI를 적용했다. [11] 각각 60kcal/mol, SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소 'RdRp' 사용). [12] 우리는 이를 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소(RdRp) 유전자를 검출하기 위한 전기화학발광(ECL) 바이오센서 설계에 적용했습니다. [13] 단일 단계 혼성화 반응의 경우 제작된 키트는 0의 고감도로 SARS-CoV-2 RNA-의존 RNA 중합효소(RdRp) 유전자의 보존 영역을 검출하는 데 상당한 감도(정전용량 변화, ΔC = ~2 nF)를 나타냈다. . [14] 이 연구에서 여러 2-((indol-3-yl)thio)-N-benzyl-acetamides가 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소(RdRp) 억제제로 확인되었습니다. [15] 이 연구는 리간드와 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소의 전자 구조의 상보성에 대한 연구에 전념하고 있습니다. [16] SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소(RdRp)의 촉매 소단위는 뉴클레오티딜-일인산 전달(NMPylation)을 촉매하는 두 개의 활성 부위를 포함합니다. [17] 기본 작용 방식에 대한 조사는 샌드크라빈이 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소 복합체를 억제하는 것으로 밝혀져 구조적으로 뚜렷한 비뉴클레오사이드 RNA 합성 억제제임을 강조했습니다. [18] 항바이러스 특성이 알려진 Spondias 몸빈 잎에서 추출한 생리활성 화합물의 선택 목록에서 SARS-CoV-2 RNA를 표적으로 하는 잠재적인 SARS-CoV-2 억제제로 Geraniin 및 2-O-Caffeoyl-(+)-allohydroxycitric acid를 식별했습니다. -의존성 폴리머라제, SARS-CoV-2 바이러스 S-단백질의 수용체 결합 도메인(RBD) 및 3C-유사 주요 프로테아제(3CLpro). [19] 여기에서 우리는 역추적이 바이러스 영역으로 확장된다는 증거를 제시하며, 여기서 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소(RdRp)에 의한 역추적은 바이러스 전사 및 복제를 도울 수 있습니다. [20] 현재, SARS-CoV-2 RNA-의존성 RNA 중합효소(RdRp, nsp12-nsp7-nsp8에 의해 인코딩됨)는 예를 들어, SARS-CoV-2 RNA-의존성 RNA 폴리머라제(RdRp, nsp12-nsp7-nsp8)에 의해 수많은 억제제의 표적이 되었습니다. [21] SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소(RdRp) 단백질은 항바이러스제 렘데시비르(RDV)의 표적이다. [22] 소포스부비르, 리바비린, 갈리데시비르, 렘데시비르, 파비피라비르, 세푸록심, 테노포비르, 히드록시클로로퀸(HCHL), 세트로부비르, YAK, IDX-184와 같은 염기 억제제는 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA에 대한 결합에 효과적인 것으로 밝혀졌다. 중합효소. [23] 잠재적으로 특정한 수라민 유사체를 설계하기 위한 이 새로운 프레임워크의 사용은 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소(RdRp) 및 뉴클레오캡시드 단백질을 사용하여 예시되어 광범위한 코로나바이러스를 억제할 수 있는 리드를 식별합니다. [24] 결과 우리는 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소(RdRp)를 표적으로 하는 siRNA인 siR-7을 시험관 내에서 바이러스 복제를 억제하는 가장 효율적인 siRNA로 확인했습니다. [25] SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 폴리머라제(RdRp) 및 메틸트랜스퍼라제(nsp16)에 대한 유망한 잠재적 결과가 제시됩니다. [26] 우리는 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소(RdRp) 연구에 대한 환원주의적 접근으로 인해 발생한 특정 오해를 설명합니다. 이는 구조 생물학에서 유감스럽게도 증가하는 추세의 한 예일 뿐입니다. [27] 재료 및 방법 SARS-CoV-2 주단백질(Mpro)(PDB ID: 6Y2F) 및 SARS-CoV-2 RNA-의존성 RNA 중합효소(RdRp)(PDB ID: 7BV2)의 결정 구조는 모두 Protein Data Bank에서 사용되었습니다. 공부하다. [28] ddhCTP는 플라비바이러스 및 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소의 절대 사슬 종결자로 작용하는 것으로 나타났습니다. 그러나 이 유망한 항바이러스제에 대한 제한된 접근으로 인해 추가 생물물리학적 연구는 배제되었습니다. [29] SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소(RdRp)는 바이러스 복제에 필수적이므로 유망한 약물 표적입니다. [30] SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소(RdRp)의 촉매 서브유닛인 Nsp12는 뉴클레오티딜-모노포스페이트(NMP) 전달(NMPylation)을 촉매하는 두 개의 활성 부위를 포함합니다. [31] 목적 우리는 SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소에 대한 Strychnos nux-vomica(독성 식물)의 식물 화합물을 컴퓨터 방법으로 연구했습니다. [32] 현재, SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소(RdRp, nsp12-nsp7-nsp8에 의해 암호화됨)는 임상적 영향에 대해 논쟁의 여지가 있는 수많은 억제제의 표적이 되었습니다. [33] SARS-CoV-2 RNA 의존성 RNA 중합효소(RdRp)의 촉매 소단위인 Nsp12는 뉴클레오사이드 모노포스페이트를 Nsp9 단백질로 전달하는 독특한 NiRAN 도메인을 가지고 있습니다. [34]