Regulatory Circuits(규제 회로)란 무엇입니까?
Regulatory Circuits 규제 회로 - This includes its reciprocal regulatory ties with NF-κB and WT1, and the more recent reports showing an involvement in regulatory circuits in cancer cells. [1] albicans growth, suggest that both yeast and hyphal forms exist in both growth patterns and the regulatory circuits are inter‐connected. [2] These analyses also allow the identification of long-range cis-regulatory circuits, including a previously unknown superenhancer of Hoxa locus, as well as larger and more detailed gene-regulatory networks, driven by transcription factors including PU. [3] Further understanding of these signals and regulatory circuits will help uncover the intimacies of the central control of puberty, as well as how alterations in metabolic status, ranging from undernutrition to obesity, affect the pubertal process. [4] Vertebrate evolution was accompanied with two rounds of whole genome duplication followed by functional divergence in terms of regulatory circuits and gene expression patterns. [5] Recent work has revealed a striking level of sophistication within the regulatory circuits that link flagellar function to surface colonization. [6] The large qualitative differences in Ucn3 expression observed between larval and adult phases suggest that the maturation of neuroregulatory circuits in the striatum, torus semicircularis and hindbrain chemosensory systems is closely related to profound life-style changes occurring after the transformation from larval to adult life. [7] Cell-based sensors are useful for many synthetic biology applications, including regulatory circuits, metabolic engineering, and diagnostics. [8] Strongyloides ratti delays its expulsion from the gut by induction of regulatory circuits in a mouse strain-specific manner: depletion of Foxp3 + regulatory T cells (Treg) improves the anti- S. [9] Gene regulation based on regulatory RNA is an important mechanism in cells and is increasingly used for regulatory circuits in synthetic biology. [10] However, only a few soybean members of this class display well-known functions; knowledge about their regulatory circuits is still rudimentary. [11] Subsequently, the differential expression of nucleic acids between these two groups was analyzed, followed by functional interaction prediction analysis to investigate gene-regulatory circuits. [12] Also, the regulatory circuits of epigenetic alterations through DNA-methylation, non-coding RNAs and histone modifications very well explain epigenetic profiling within plants. [13] This basic mechanism yields diverse cellular consequences, including the removal of misfolded proteins, control of regulatory circuits, and remodeling of protein conformation. [14] Testing this hypothesis has been a challenge due to the redundancy of the Cu microRNAs and the properties of the regulatory circuits that control Cu homeostasis. [15] Initially, highly variable rats with the development of diabetes do not lose temperature sensitivity, but demonstrate an imbalance in the regulatory circuits of heart rate and HRV. [16] We aim at filling in this gap by integrating of both signalling and metabolic pathways allowing a visual exploration of multi-level omics data and study of cross-regulatory circuits between these processes in health and in disease. [17] Altogether, elucidation of the physiological roles of these signals and regulatory circuits will help uncover the intimacies of the brain control of puberty, and its alterations in conditions of metabolic stress, ranging from subnutrition to obesity. [18] aeruginosa employs several hierarchically arranged and interconnected quorum sensing (QS) regulatory circuits to produce a battery of virulence factors such as elastase, phenazines, and rhamnolipids. [19] Knowledge on the ecology of these bacteria is hindered due to our limited knowledge of the regulatory circuits that control differentiation and specialization processes. [20]여기에는 NF-κB 및 WT1과의 상호 조절 관계와 암세포의 조절 회로에 관여하는 것을 보여주는 최근 보고서가 포함됩니다. [1] albicans의 성장은 효모와 균사 형태가 모두 성장 패턴에 존재하고 조절 회로가 상호 연결되어 있음을 시사합니다. [2] 이러한 분석은 또한 이전에 알려지지 않은 Hoxa 유전자좌의 슈퍼인핸서와 PU를 포함한 전사 인자에 의해 구동되는 더 크고 더 상세한 유전자 조절 네트워크를 포함한 장거리 시스 조절 회로의 식별을 허용합니다. [3] 이러한 신호와 조절 회로에 대한 더 깊은 이해는 사춘기의 중앙 통제의 친밀함과 영양 결핍에서 비만에 이르는 대사 상태의 변화가 사춘기 과정에 어떻게 영향을 미치는지 밝히는 데 도움이 될 것입니다. [4] 척추동물의 진화는 두 차례의 전체 게놈 복제와 함께 조절 회로와 유전자 발현 패턴의 기능적 차이를 동반했습니다. [5] 최근 연구는 편모 기능을 표면 집락화와 연결하는 조절 회로 내에서 놀라운 수준의 정교함을 드러냈습니다. [6] 유충과 성충 단계 사이에서 관찰된 Ucn3 발현의 큰 질적 차이는 선조체, 원환체 반고리 및 후뇌 화학 감각 시스템의 신경 조절 회로의 성숙이 유충에서 성충으로의 변환 후 발생하는 심오한 생활 방식 변화와 밀접하게 관련되어 있음을 시사합니다. [7] 세포 기반 센서는 조절 회로, 대사 공학 및 진단을 포함한 많은 합성 생물학 응용 분야에 유용합니다. [8] Strongyloides ratti는 마우스 계통 특이적 방식으로 조절 회로를 유도하여 장에서 배출을 지연시킵니다. Foxp3 + 조절 T 세포(Treg)의 고갈은 항-S. [9] 조절 RNA에 기반한 유전자 조절은 세포에서 중요한 메커니즘이며 합성 생물학에서 조절 회로에 점점 더 많이 사용되고 있습니다. [10] 그러나 이 클래스의 소수의 대두 구성원만이 잘 알려진 기능을 표시합니다. 규제 회로에 대한 지식은 아직 초보적입니다. [11] 그 후, 이들 두 그룹 사이의 핵산의 차등 발현을 분석하고, 유전자 조절 회로를 조사하기 위한 기능적 상호작용 예측 분석을 수행하였다. [12] 또한, DNA-메틸화, 비암호화 RNA 및 히스톤 변형을 통한 후성유전적 변경의 조절 회로는 식물 내 후성적 프로파일링을 매우 잘 설명합니다. [13] 이 기본 메커니즘은 잘못 접힌 단백질의 제거, 조절 회로의 제어 및 단백질 형태의 리모델링을 포함하여 다양한 세포 결과를 산출합니다. [14] Cu microRNA의 중복성과 Cu 항상성을 제어하는 조절 회로의 특성으로 인해 이 가설을 테스트하는 것은 어려운 일이었습니다. [15] 초기에 당뇨병이 발병한 가변성이 높은 쥐는 온도 민감도를 잃지 않지만 심박수와 HRV의 조절 회로에서 불균형을 나타냅니다. [16] 우리는 신호 및 대사 경로를 통합하여 다단계 omics 데이터를 시각적으로 탐색하고 건강 및 질병에서 이러한 프로세스 사이의 교차 조절 회로에 대한 연구를 가능하게 하여 이 격차를 채우는 것을 목표로 합니다. [17] 전체적으로 이러한 신호와 조절 회로의 생리학적 역할에 대한 설명은 사춘기의 뇌 조절과 영양 결핍에서 비만에 이르는 대사 스트레스 조건의 변화를 밝히는 데 도움이 될 것입니다. [18] 녹농균은 엘라스타제, 페나진 및 람노지질과 같은 독성 인자 배터리를 생성하기 위해 여러 계층적으로 배열되고 상호 연결된 쿼럼 감지(QS) 조절 회로를 사용합니다. [19] 이러한 박테리아의 생태학에 대한 지식은 분화 및 전문화 과정을 제어하는 조절 회로에 대한 우리의 제한된 지식으로 인해 방해를 받습니다. [20]
Gene Regulatory Circuits 유전자 조절 회로
Nontrivial classical genetic and transcriptomic approaches have revealed essential molecular mechanisms and gene regulatory circuits that drive neural crest-derived cell fate decisions. [1] In multicellular organisms, gene regulatory circuits generate thousands of molecularly distinct, mitotically heritable states, through the property of multistability. [2] Such traits are known to be mediated by heritable chromatin structures, by the mitotic transmission of transcription factors involved in gene regulatory circuits or by the cytoplasmic partition of prions or other unstructured proteins. [3] Conclusions We propose that cancer-associated genome hypomethylation simulates the open chromatin landscape of more primitive cell states, and that on this relatively unrestricted background, SOX10 recreates its ancestral gene regulatory circuits by default. [4] Subsequently, experimental evidence is presented supporting the idea that different cell types within the leaf epidermis, namely stomata, hydathodes pores, pavement cells and trichomes, either share developmental origins or mutually influence each other’s gene regulatory circuits during development. [5] Cancer is caused primarily by genomic alterations resulting in deregulation of gene regulatory circuits in key growth, apoptosis, or DNA repair pathways. [6] SUMMARY GeneEx is an interactive web-app that uses an ODE-based mathematical modeling approach to simulate, visualize and analyze gene regulatory circuits (GRCs) for an explicit kinetic parameter set or for a large ensemble of random parameter sets. [7] The lac operon is one of the best known gene regulatory circuits and constitutes a landmark example of how bacteria tune their metabolism to nutritional conditions. [8] Here we describe a basic protocol for the design of synthetic gene regulatory circuits. [9] Recent advances in microfluidic devices allowed cell-free reactions to run under nonequilibrium, steady-state conditions enabling the implementation of dynamic gene regulatory circuits in vitro. [10] A network-based analysis of TF-enhancer-gene regulatory circuits revealed a core TF-gene module (58 interactions including seven genes and 14 TFs) that was associated survival of patients with glioma (p < 0. [11] We found that key patterns of this EMT path are observed in EMT progression in non-tumorigenic cells and that transcription factor ZEB1 plays a key role in defining this EMT path via diverse gene regulatory circuits connecting to epithelial genes. [12] Investigations into single-cell expression of RNA splicing variants offer a venue for resolving gene regulatory circuits, mapping intracellular localization, and classifying cell types. [13] Synthetic Biology Synthetic biologists would like to be able to make gene regulatory circuits that mimic key properties of eukaryotic gene regulation. [14] The ability to study gene regulatory circuits, cellular behavior, signaling pathways, and molecular players involved in biomineralization is significantly boosted by the high level of autonomy of PMCs. [15] Analysis of gene expression in the neural crest of vertebrate embryos supports the idea that gene regulatory circuits that define the cranial neural crest evolved gradually from a more trunk-like identity. [16] These assays are aimed at the identification of interactions between transcription factors and regulatory elements in the genome, and, in combination with functional assays, can be used for the delineation of gene regulatory circuits. [17] Our work provides new insight into RBP-based regulation and a blueprint for designing complete gene regulatory circuits at the post-transcriptional level. [18] Although unremitting efforts have been devoted to improve lipopeptide production by designing gene regulatory circuits or optimizing fermentation process, little attention has been paid to utilizing multi-omics for systematically mining core genes and proteins during the bacterial growth cycle. [19] Taken together, this E-protein dependence suggests that the appearance of the full Gnathostomata E-protein repertoire was critical to reinforce the gene regulatory circuits that drove the emergence and expansion of the lineages constituting humoral immunity. [20] We propose that targeting gene regulatory circuits, such as those controlling SNAI2 function, may allow reversion of RA-therapy resistant neuroblastoma cells to a more differentiated and therapy responsive phenotype. [21] Cooperativity in synthetic gene circuits Synthetic biologists would like to be able to make gene regulatory circuits that mimic key properties of eukaryotic gene regulation. [22] ConclusionsXL-DNase-seq may help extract novel gene regulatory circuits involving previously undetectable TFs. [23] Here, we explored gene regulatory circuits that can generate multiple intermediate cellular states with stepwise modulations of transcription factors. [24] In the past two decades, it has been discovered that certain motifs, such as the feedforward motif, are overrepresented in gene regulatory circuits. [25] How cytokine‐driven changes in chromatin topology are converted into gene regulatory circuits during inflammation still remains unclear. [26] Lastly, we discuss the case of bursty gene regulatory circuits that, even in the fast switching limit, function out of equilibrium. [27]중요하지 않은 고전적 유전 및 전사체 접근법은 신경 능선에서 유래한 세포 운명 결정을 구동하는 필수 분자 메커니즘 및 유전자 조절 회로를 밝혀냈습니다. [1] 다세포 유기체에서 유전자 조절 회로는 다중안정성의 특성을 통해 분자적으로 구별되고 유사분열적으로 유전될 수 있는 수천 개의 상태를 생성합니다. [2] 이러한 특성은 유전 가능한 염색질 구조, 유전자 조절 회로에 관련된 전사 인자의 유사분열 전달 또는 프리온 또는 기타 구조화되지 않은 단백질의 세포질 분할에 의해 매개되는 것으로 알려져 있습니다. [3] 결론 우리는 암 관련 게놈 저메틸화가 더 원시적인 세포 상태의 열린 염색질 풍경을 시뮬레이션하고, 이 상대적으로 제한되지 않은 배경에서 SOX10이 기본적으로 조상 유전자 조절 회로를 재생성한다고 제안합니다. [4] 그 후, 잎 표피 내의 다양한 세포 유형, 즉 기공, Hydathodes pore, 포장 세포 및 trichomes가 발달 기원을 공유하거나 발달 중에 서로의 유전자 조절 회로에 상호 영향을 미친다는 아이디어를 뒷받침하는 실험적 증거가 제시됩니다. [5] 암은 주로 주요 성장, 세포 사멸 또는 DNA 복구 경로에서 유전자 조절 회로의 규제 완화를 초래하는 게놈 변경으로 인해 발생합니다. [6] 요약 GeneEx는 ODE 기반 수학적 모델링 접근 방식을 사용하여 명시적 운동 매개변수 세트 또는 무작위 매개변수 세트의 대규모 앙상블에 대한 유전자 조절 회로(GRC)를 시뮬레이션, 시각화 및 분석하는 대화형 웹 앱입니다. [7] lac 오페론은 가장 잘 알려진 유전자 조절 회로 중 하나이며 박테리아가 영양 상태에 맞게 대사를 조정하는 방법의 획기적인 예를 구성합니다. [8] 여기에서 우리는 합성 유전자 조절 회로의 설계를 위한 기본 프로토콜을 설명합니다. [9] nan [10] nan [11] 우리는 이 EMT 경로의 주요 패턴이 비종양형성 세포의 EMT 진행에서 관찰되고 전사 인자 ZEB1이 상피 유전자에 연결되는 다양한 유전자 조절 회로를 통해 이 EMT 경로를 정의하는 데 핵심 역할을 한다는 것을 발견했습니다. [12] RNA 스플라이싱 변이체의 단일 세포 발현에 대한 조사는 유전자 조절 회로를 해결하고, 세포 내 위치를 매핑하고, 세포 유형을 분류하기 위한 장소를 제공합니다. [13] 합성생물학 합성 생물학자들은 진핵생물 유전자 조절의 주요 특성을 모방하는 유전자 조절 회로를 만들 수 있기를 원합니다. [14] 유전자 조절 회로, 세포 행동, 신호 전달 경로 및 생체 광물화에 관여하는 분자 플레이어를 연구하는 능력은 PMC의 높은 수준의 자율성에 의해 크게 향상됩니다. [15] 척추동물 배아의 신경 능선에서 유전자 발현 분석은 뇌신경 능선을 정의하는 유전자 조절 회로가 몸통과 같은 정체성에서 점차적으로 진화했다는 아이디어를 뒷받침합니다. [16] 이러한 분석은 전사 인자와 게놈의 조절 요소 간의 상호 작용을 식별하는 것을 목표로 하며 기능 분석과 함께 유전자 조절 회로의 묘사에 사용할 수 있습니다. [17] 우리의 연구는 RBP 기반 조절에 대한 새로운 통찰력과 전사 후 수준에서 완전한 유전자 조절 회로를 설계하기 위한 청사진을 제공합니다. [18] 유전자 조절 회로를 설계하거나 발효 과정을 최적화하여 리포펩티드 생산을 개선하기 위한 끊임없는 노력이 있었지만 박테리아 성장 주기 동안 핵심 유전자와 단백질을 체계적으로 마이닝하기 위해 멀티오믹스를 활용하는 데 거의 관심을 기울이지 않았습니다. [19] 종합하면, 이러한 E-단백질 의존성은 전체 Gnathostomata E-단백질 레퍼토리의 출현이 체액성 면역을 구성하는 계통의 출현 및 확장을 주도한 유전자 조절 회로를 강화하는 데 중요했음을 시사합니다. [20] 우리는 SNAI2 기능을 제어하는 것과 같은 유전자 조절 회로를 표적으로 하는 것이 RA 치료 저항성 신경모세포종 세포를 보다 분화되고 치료 반응성 표현형으로 되돌릴 수 있다고 제안합니다. [21] nan [22] nan [23] nan [24] nan [25] nan [26] nan [27]
Complex Regulatory Circuits
This work is one step further in understanding the complex regulatory circuits underlying SSC function. [1] Many of these miRNAs are involved in complex regulatory circuits necessary for the fine-tuning of biological functions including inflammatory processes or cell growth. [2] Understanding the complex regulatory circuits that couple nitrogen fixation to ammonium assimilation is a prerequisite for engineering diazotrophic strains that can potentially supply fixed nitrogen to non-legume crops. [3] Complex regulatory circuits determine whether DNA double‐strand breaks (DSBs) are repaired by nonhomologous end‐joining (NHEJ) or homology‐directed repair (HDR) pathways, a carefully balanced equilibrium of which is critical for genome stability. [4] Biofilm formation is an important virulence factor which is controlled by complex regulatory circuits in Pseudomonas aeruginosa. [5] The study of the genetics of enterococci has focused heavily on mobile genetic elements present in these organisms, the complex regulatory circuits used to control their mobility, and the antibiotic resistance genes they frequently carry. [6] The availability or activity of the sigma factor is regulated by complex regulatory circuits, the majority of which are post-transcriptional. [7]이 작업은 SSC 기능의 기본이 되는 복잡한 규제 회로를 이해하는 데 한 단계 더 나아간 것입니다. [1] 이러한 miRNA 중 다수는 염증 과정이나 세포 성장을 포함한 생물학적 기능의 미세 조정에 필요한 복잡한 조절 회로에 관여합니다. [2] 질소 고정을 암모늄 동화와 연결하는 복잡한 규제 회로를 이해하는 것은 잠재적으로 고정 질소를 콩과 식물이 아닌 작물에 공급할 수 있는 디아조영양 균주를 엔지니어링하기 위한 전제 조건입니다. [3] 복잡한 조절 회로는 DNA 이중 가닥 파손(DSB)이 NHEJ(비상동 말단 연결) 또는 상동성 지향 복구(HDR) 경로에 의해 복구되는지 여부를 결정하며, 이들의 균형 잡힌 균형은 게놈 안정성에 중요합니다. [4] nan [5] nan [6] nan [7]
Transcriptional Regulatory Circuits 전사 조절 회로
The majority of the target genes play major roles in antigen presentation and immune response and are regulated through complex transcriptional regulatory circuits, including those in HLA (6p21) and non-HLA (16p11. [1] Notably, transcriptional regulatory circuits in young panicles covering the stamen at stages 4–6 were substantially altered in the CRISPR line compared to the dSpm line. [2] GRNs are systems of transcriptional regulatory circuits that control the differential specification of cell fates during development by regulating gene expression. [3] CP synthesis is determined by transcriptional and post-transcriptional regulatory circuits. [4] , TF regulon) is becoming a widely used approach to characterize the functional status of transcriptional regulatory circuits. [5] However, CP synthesis remains growth phase-dependent even when capA transcription is rendered constitutive, suggesting additional post-transcriptional regulatory circuits. [6]대부분의 표적 유전자는 항원 제시 및 면역 반응에서 중요한 역할을 하며 HLA(6p21) 및 비-HLA(16p11)를 포함하는 복잡한 전사 조절 회로를 통해 조절됩니다. [1] 특히, 4-6단계에서 수술을 덮는 어린 원추꽃차례의 전사 조절 회로는 dSpm 라인과 비교하여 CRISPR 라인에서 실질적으로 변경되었습니다. [2] GRN은 유전자 발현을 조절함으로써 발달 동안 세포 운명의 차등적 사양을 제어하는 전사 조절 회로의 시스템입니다. [3] CP 합성은 전사 및 전사 후 조절 회로에 의해 결정됩니다. [4] nan [5] nan [6]
Genetic Regulatory Circuits 유전 조절 회로
Our findings have broad implications for understanding the architecture of genetic regulatory circuits that induce the initial events of otic neurosensory lineage establishment and maintenance. [1] Engineering genetic regulatory circuits is key to the creation of biological applications that are responsive to environmental changes. [2] In addition, certain genetic regulatory circuits with positive feedback loops and stochastic differences in gene expression can generate endogenous fluctuations in regulatory components leading to bistable expression of virulence-associated functions. [3] The limitations of cell-based synthetic biology are becoming increasingly apparent as researchers aim to develop larger and more complex synthetic genetic regulatory circuits. [4] In this review, we investigate the extent to which these genetic regulatory circuits affect cancer predisposition and how the recent development of genome-editing methods have enabled the determination of the impacts of genomic variation and alteration on cancer phenotype, which will eventually lead to better management plans and treatment responses to human cancer in the clinic. [5]우리의 연구 결과는 귀 신경 감각 계통 수립 및 유지의 초기 이벤트를 유도하는 유전적 조절 회로의 구조를 이해하는 데 광범위한 의미가 있습니다. [1] 유전자 조절 회로를 엔지니어링하는 것은 환경 변화에 반응하는 생물학적 응용 프로그램을 만드는 데 중요합니다. [2] 또한, 양성 피드백 루프 및 유전자 발현의 확률적 차이가 있는 특정 유전자 조절 회로는 독성 관련 기능의 쌍안정 발현으로 이어지는 조절 구성요소의 내인성 변동을 생성할 수 있습니다. [3] 연구자들이 더 크고 복잡한 합성 유전 조절 회로를 개발하는 것을 목표로 함에 따라 세포 기반 합성 생물학의 한계가 점점 더 분명해지고 있습니다. [4] nan [5]
Key Regulatory Circuits
Using data from The Cancer Genome Atlas, we inferred probabilistic multilayer networks, identifying key regulatory circuits able to (partially) explain the alterations that lead from a healthy phenotype to different manifestations of breast cancer, as captured by its molecular subtype classification. [1] In this way, key regulatory circuits are identified, where genes such as TP53, ESR1, BRCA1, MYC, and others, that are known to be important genetic factors for the cause of breast cancer, produce transcription factors that target the same genes as well as interact with the selected miRNAs. [2] Key regulatory circuits induced by hypoxia in TOF pathogenesis after birth were unveiled. [3] • Altered functional organisation may mean potential impairment of communication among key regulatory circuits. [4]Cancer Genome Atlas의 데이터를 사용하여 확률론적 다층 네트워크를 추론하여 분자 하위 유형 분류에 의해 포착된 건강한 표현형에서 유방암의 다양한 발현으로 이어지는 변경을 (부분적으로) 설명할 수 있는 주요 조절 회로를 식별했습니다. [1] 이와 같이 TP53, ESR1, BRCA1, MYC 등과 같은 유방암의 원인에 중요한 유전인자로 알려진 유전자가 동일한 유전자를 표적으로 하는 전사인자를 생산하는 핵심 조절회로를 규명한다. 선택된 miRNA와 상호작용합니다. [2] 출생 후 TOF 발병 기전에서 저산소증에 의해 유도된 주요 조절 회로가 공개되었습니다. [3] • 변경된 기능 조직은 주요 규제 회로 간의 잠재적인 통신 손상을 의미할 수 있습니다. [4]
Synthetic Regulatory Circuits 합성 조절 회로
In contrast, synthetic regulatory circuits, which allow the timed shutdown of gene expression, are rarely available and therefore represent highly attractive tools for metabolic engineering. [1] report synthetic regulatory circuits based on protein phosphorylation reactions that respond to inputs within seconds (see the Perspective by Kholodenko and Okada). [2] In addition to its implementation in synthetic regulatory circuits, the sTALE system allows the analysis of protein-protein interactions in planta. [3] These results provide a system to characterize regulatory elements and use these elements in the design of synthetic regulatory circuits. [4]대조적으로, 유전자 발현의 시기적절한 종료를 허용하는 합성 조절 회로는 거의 이용 가능하지 않으므로 대사 공학을 위한 매우 매력적인 도구를 나타냅니다. [1] 몇 초 안에 입력에 반응하는 단백질 인산화 반응을 기반으로 하는 합성 조절 회로를 보고합니다(Kholodenko 및 Okada의 Perspective 참조). [2] 합성 조절 회로에서 구현하는 것 외에도 sTALE 시스템을 사용하면 식물에서 단백질-단백질 상호작용을 분석할 수 있습니다. [3] 이러한 결과는 규제 요소를 특성화하고 합성 규제 회로 설계에 이러한 요소를 사용하는 시스템을 제공합니다. [4]
Novel Regulatory Circuits
SlyA/RovA TFs in different species have independently evolved novel regulatory circuits to provide the enhanced levels of expression required for their new role. [1] The aim of this work is to increase recombinant protein expression in Pichia pastoris over the ethanol utilization pathway under novel‐engineered promoter variants (NEPVs) of alcohol dehydrogenase 2 promoter (PADH2) through the generation of novel regulatory circuits. [2] To conclude, we propose 2 novel regulatory circuits mediated by miR‐381‐3p in BCa, which may assist in the development of more effective therapies against BCa in the future. [3]다른 종의 SlyA/RovA TF는 새로운 역할에 필요한 향상된 수준의 발현을 제공하기 위해 독립적으로 새로운 조절 회로를 진화시켰습니다. [1] 이 연구의 목적은 새로운 조절 회로의 생성을 통해 알코올 탈수소효소 2 프로모터(PADH2)의 신규 조작된 프로모터 변이체(NEPV)에서 에탄올 이용 경로를 통해 피치아 파스토리스에서 재조합 단백질 발현을 증가시키는 것입니다. [2] 결론적으로, 우리는 BCa에서 miR-381-3p에 의해 매개되는 2개의 새로운 조절 회로를 제안하며, 이는 미래에 BCa에 대한 보다 효과적인 치료법 개발에 도움이 될 수 있습니다. [3]
Different Regulatory Circuits
By measuring transcriptional changes in more than 700 E-genes and M-genes, we discovered that the M-genes exhibit a significant diversity in their dependency to these regulatory elements and identified three groups of M-genes that are controlled by different regulatory circuits. [1] By measuring transcriptional changes in more than 700 E-genes and M-genes, we discovered that the M-genes exhibit a significant diversity in their dependency to these regulatory elements and identified three groups of M-genes that are controlled by different regulatory circuits. [2] By measuring transcriptional changes in more than 700 E- and M-genes, we discovered that the M-genes exhibit a significant diversity in their dependency to these regulatory elements and identified three groups of M-genes that are controlled by different regulatory circuits. [3]700개 이상의 E-유전자 및 M-유전자의 전사 변화를 측정함으로써, 우리는 M-유전자가 이러한 조절 요소에 대한 의존성에서 상당한 다양성을 나타낸다는 것을 발견하고 서로 다른 조절 회로에 의해 제어되는 3개의 M-유전자 그룹을 확인했습니다. [1] 700개 이상의 E-유전자 및 M-유전자의 전사 변화를 측정함으로써, 우리는 M-유전자가 이러한 조절 요소에 대한 의존성에서 상당한 다양성을 나타낸다는 것을 발견하고 서로 다른 조절 회로에 의해 제어되는 3개의 M-유전자 그룹을 확인했습니다. [2] nan [3]
Specific Regulatory Circuits 특정 규제 회로
Although most of the SLE-associated loci are located in regulatory regions, there is a lack of global information about transcription factor (TFs) activities, the mode of regulation of the TFs, or the cell or sample-specific regulatory circuits. [1] In addition to controlled expression of genes by specific regulatory circuits, the abundance of proteins and transcripts can also be influenced by physiological states of the cell such as growth rate and metabolism. [2] Our integrated approach, allowing dissection of cell-type-specific regulatory circuits in vivo, has broad implications for GRN discovery and investigation. [3]대부분의 SLE 관련 유전자좌는 조절 영역에 위치하지만 전사 인자(TF) 활동, TF의 조절 모드 또는 세포 또는 샘플 특이적 조절 회로에 대한 전체적인 정보가 부족합니다. [1] 특정 조절 회로에 의한 유전자 발현 조절 외에도 단백질 및 전사체의 풍부함은 성장률 및 대사와 같은 세포의 생리학적 상태에 의해 영향을 받을 수도 있습니다. [2] 생체 내에서 세포 유형별 조절 회로의 해부를 허용하는 우리의 통합 접근 방식은 GRN 발견 및 조사에 광범위한 영향을 미칩니다. [3]
Core Regulatory Circuits 핵심 규제 회로
RESULTS Superenhancer distribution revealed a group of potential TFs in core regulatory circuits in human glomerulus cells, including FOXC1/2, WT1, and LMX1B. [1] Integrating topologic, expression and epigenetic analyses of 1,016 patient specimens, we report super-enhancer core regulatory circuits (SECRCs) that drive and sustain MM epigenetic states. [2] We further dissect pioneer factors and core regulatory circuits across islet cell differentiation and maturation stages, which identify LMX1B as a key regulator of in vitro-derived endocrine progenitors. [3]결과 Superenhancer 분포는 FOXC1/2, WT1 및 LMX1B를 포함하여 인간 사구체 세포의 핵심 조절 회로에서 잠재적인 TF 그룹을 밝혔습니다. [1] 1,016명의 환자 표본에 대한 위상, 발현 및 후성 유전학적 분석을 통합하여 MM 후성 유전 상태를 유도하고 유지하는 SECRC(Super-enhancer Core Regulation Circuits)를 보고합니다. [2] nan [3]
Underlying Regulatory Circuits 기본 규제 회로
Investigations into the mechanism of stimulation of the silent virulence factor malleicyprol by the β-lactam piperacillin allowed us to elucidate the underlying regulatory circuits. [1] The root system of the model plant Arabidopsis thaliana is the ideal system to obtain insights into fundamental key parameters and molecular players involved in underlying regulatory circuits of root growth, particularly in responses to environmental stimuli. [2] SummaryThese models highlight the insights gained via mathematical modeling approaches and emphasizes that the connections between hybrid E/M phenotype(s) and stemness can be explained by analyzing underlying regulatory circuits. [3]β-락탐 피페라실린에 의한 침묵 독성 인자 malleicyprol의 자극 메커니즘에 대한 조사는 우리가 기본 조절 회로를 해명하도록 하였다. [1] 모델 식물 Arabidopsis thaliana의 뿌리 시스템은 특히 환경 자극에 대한 반응에서 뿌리 성장의 기본 조절 회로와 관련된 기본적인 주요 매개변수 및 분자 플레이어에 대한 통찰력을 얻는 이상적인 시스템입니다. [2] nan [3]
Dependent Regulatory Circuits
Currently, physiological miR-150-dependent regulatory circuits and causes of their malfunctioning that underlie the pathogenesis of allergic and autoimmune disorders are being unraveled. [1] The glucocorticoid receptor (GR) represents the crucial molecular mediator of key endocrine, glucocorticoid hormone–dependent regulatory circuits, including control of glucose, protein, and lipid homeostasis. [2]현재, 생리학적 miR-150 의존적 조절 회로와 알레르기 및 자가면역 질환의 발병기전의 기초가 되는 오작동의 원인이 밝혀지고 있습니다. [1] 글루코코르티코이드 수용체(GR)는 포도당, 단백질 및 지질 항상성의 제어를 포함하는 주요 내분비, 글루코코르티코이드 호르몬 의존적 조절 회로의 중요한 분자 매개체를 나타냅니다. [2]
Sleep Regulatory Circuits
The AAV-mediated manipulation of specific cell populations and/or of precise molecular components has been tremendously useful to identify new sleep regulatory circuits/molecules and key proteins contributing to the adverse effects of sleep loss. [1] The historic sleep regulatory paradigm invokes "top-down" imposition of sleep on the brain by sleep regulatory circuits. [2]특정 세포 집단 및/또는 정확한 분자 구성요소의 AAV 매개 조작은 수면 손실의 부작용에 기여하는 새로운 수면 조절 회로/분자 및 주요 단백질을 식별하는 데 매우 유용합니다. [1] 역사적인 수면 조절 패러다임은 수면 조절 회로에 의해 뇌에 수면을 "하향식"으로 부과합니다. [2]
Both Regulatory Circuits
Both regulatory circuits were induced in a dose-dependent manner in the presence of 0. [1] Both regulatory circuits were induced in a dose-dependent manner in the presence of aspirin in the range of 0. [2]두 조절 회로는 모두 0이 있는 상태에서 용량 의존적으로 유도되었습니다. [1] 두 조절 회로는 0 범위의 아스피린이 있는 상태에서 용량 의존적으로 유도되었습니다. [2]
Perturb Regulatory Circuits
Since Hsp83 and hnRNPs are also known to interact, elevated Hsp83 in an altered background of hnRNP distribution and dynamics, due to near absence of hsrω lncRNAs and omega speckles, can severely perturb regulatory circuits with unexpected consequences, including down-regulation of tumour-suppressor genes such as l(2)gl. [1] Thus, elevated Hsp83 in altered hnRNP distribution and dynamics, following absence of hsrω lncRNAs and omega speckles, background can severely perturb regulatory circuits with unexpected consequences, including down-regulation of tumor suppressor gene like l(2)gl. [2]Hsp83과 hnRNP도 상호 작용하는 것으로 알려져 있기 때문에 hsrω lncRNA와 오메가 반점이 거의 없기 때문에 hnRNP 분포 및 역학의 변경된 배경에서 Hsp83이 증가하면 종양 억제 인자의 하향 조절을 비롯한 예상치 못한 결과로 조절 회로를 심각하게 교란시킬 수 있습니다. l(2)gl과 같은 유전자. [1] 따라서, hsrω lncRNA 및 오메가 반점이 없는 변경된 hnRNP 분포 및 역학에서 상승된 Hsp83은 배경이 l(2)gl과 같은 종양 억제 유전자의 하향 조절을 포함하여 예상치 못한 결과로 조절 회로를 심각하게 교란시킬 수 있습니다. [2]
Translational Regulatory Circuits
Here, we highlight recent studies that reveal how physiologically relevant signals initiate post-transcriptional and post-translational regulatory circuits and the impact on virulence gene expression in the attaching and effacing pathogens, enteropathogenic Escherichia coli, enterohemorrhagic E. [1] Network analysis identified hundreds of gene modules with distinct functions and transcript sequence features indicating the existence of separate translational regulatory circuits possibly acting through specific regulatory elements. [2]여기에서 우리는 생리학적으로 관련된 신호가 전사 후 및 번역 후 조절 회로를 시작하는 방법과 병원체, 장내 병원성 대장균, 장출혈성 E. [1] nan [2]
Posttranscriptional Regulatory Circuits
ABSTRACT Bordetella pertussis has been shown to encode regulatory RNAs, yet the posttranscriptional regulatory circuits on which they act remain to be fully elucidated. [1] However, CP synthesis remains growth phase‐dependent even when transcription is rendered constitutive, suggesting additional posttranscriptional regulatory circuits. [2]Associated Regulatory Circuits
Evidence has rapidly accumulated from numerous studies on how lncRNAs function in associated regulatory circuits during SICD. [1] Although many genes involved in Xanthomonas virulence have been identified through molecular and cellular studies, the elucidation of virulence-associated regulatory circuits is still far from complete. [2]SICD 동안 관련 조절 회로에서 lncRNA가 어떻게 기능하는지에 대한 수많은 연구로부터 증거가 빠르게 축적되었습니다. [1] nan [2]
Variou Regulatory Circuits 다양한 규제 회로
Here, we propose alternative technology that transiently targets various regulatory circuits within a plant, leading to operator-specified alterations of agronomic traits, such as time of flowering, vernalization requirement, plant height or drought tolerance. [1] The developed system paves the way for studying various regulatory circuits involving proteins or sRNAs as mRNA- targeting trans-regulators in mycobacteria as well as in other actinobacterial species. [2]여기에서 우리는 식물 내의 다양한 조절 회로를 일시적으로 표적으로 하여 개화 시기, 춘화 요구 사항, 식물 높이 또는 가뭄 내성과 같은 농경학적 특성의 운영자 지정 변경으로 이어지는 대체 기술을 제안합니다. [1] 개발된 시스템은 마이코박테리아와 다른 방선박테리아 종에서 mRNA를 표적으로 하는 트랜스-조절자로서 단백질 또는 sRNA를 포함하는 다양한 조절 회로를 연구할 수 있는 길을 열어줍니다. [2]
Immune Regulatory Circuits 면역 조절 회로
Thus, the outcome of PD-L1 intervention may depend on the final balance among the highly dynamic and heterogeneous immune regulatory circuits. [1] In addition, associations between concentrations of BDNF and neopterin as well as serum nitrite levels were found in patients after rTMS treatment, which indicates an influence of immune regulatory circuits on BDNF levels. [2]따라서 PD-L1 개입의 결과는 매우 역동적이고 이질적인 면역 조절 회로 간의 최종 균형에 달려 있을 수 있습니다. [1] 또한, rTMS 치료 후 환자에서 BDNF와 네오프테린 농도 및 혈청 아질산염 농도 사이의 연관성이 발견되었으며, 이는 BDNF 수준에 대한 면역 조절 회로의 영향을 나타냅니다. [2]
Feedback Regulatory Circuits 피드백 조절 회로
While bacterial riboswitches had been initially thought to control production of enzymes and transporters associated with small organic molecules via feedback regulatory circuits, later findings identified riboswitches directing expression of a wide range of genes and responding to various classes of molecules, including ions, signaling molecules, and others. [1] These findings suggest that GA feedback regulatory circuits play a fundamental role in leaf margin formation, in which the posttranslational interaction between transcription factors functions as an additional feature. [2]박테리아 리보스위치는 초기에 피드백 조절 회로를 통해 작은 유기 분자와 관련된 수송체 및 효소의 생산을 제어하는 것으로 생각되었지만, 이후 발견은 리보스위치가 광범위한 유전자의 발현을 지시하고 이온, 신호 분자, 다른 사람. [1] 이러한 발견은 GA 피드백 조절 회로가 전사 인자 간의 번역 후 상호 작용이 추가 기능으로 기능하는 잎 여백 형성에서 근본적인 역할을 한다는 것을 시사합니다. [2]
regulatory circuits involving 관련된 규제 회로
They may include regulatory circuits involving precursor Band T-cell maturation and thymic epithelium function explaining coexistence of HG, T-cell autoimmunity, and propensity for clonal expansion [5]. [1] The developed system paves the way for studying various regulatory circuits involving proteins or sRNAs as mRNA- targeting trans-regulators in mycobacteria as well as in other actinobacterial species. [2] Recent data argue for a pro-inflammatory role of CAMP (cathelicidin antimicrobial peptide) in adipocytes and adipose tissue (AT) and for regulatory circuits involving TLRs. [3] ConclusionsXL-DNase-seq may help extract novel gene regulatory circuits involving previously undetectable TFs. [4]여기에는 HG의 공존, T 세포 자가면역 및 클론 확장 성향을 설명하는 전구체 밴드 T 세포 성숙 및 흉선 상피 기능을 포함하는 조절 회로가 포함될 수 있습니다[5]. [1] 개발된 시스템은 마이코박테리아와 다른 방선박테리아 종에서 mRNA를 표적으로 하는 트랜스-조절자로서 단백질 또는 sRNA를 포함하는 다양한 조절 회로를 연구할 수 있는 길을 열어줍니다. [2] nan [3] nan [4]
regulatory circuits underlying
This work is one step further in understanding the complex regulatory circuits underlying SSC function. [1] The devastating clinical outcome and lack of effective preventative therapeutics for metastatic melanoma necessitate the development of new therapeutic strategies targeted to inhibit the regulatory circuits underlying the progression and metastasis of melanoma. [2] In conclusion, we present an atlas of immune cell infiltrates of human melanoma, revealing intra- and inter-patient heterogeneity of tumor immune infiltrates, highlighting regulatory circuits underlying different immune populations and their interactions. [3]이 작업은 SSC 기능의 기본이 되는 복잡한 규제 회로를 이해하는 데 한 단계 더 나아간 것입니다. [1] 파괴적인 임상 결과와 전이성 흑색종에 대한 효과적인 예방 치료제의 부족으로 인해 흑색종의 진행 및 전이의 기초가 되는 조절 회로를 억제하기 위한 새로운 치료 전략의 개발이 필요합니다. [2] 결론적으로, 우리는 인간 흑색종의 면역 세포 침윤물의 아틀라스를 제시하여 종양 면역 침윤물의 환자 내 및 환자간 이질성을 드러내고 다양한 면역 집단과 이들의 상호 작용을 뒷받침하는 조절 회로를 강조합니다. [3]
regulatory circuits mediated
Cancer cells can evade the attack from host immune systems via hijacking the regulatory circuits mediated by immune checkpoints. [1] The regulatory circuits mediated by TLR activation, which modulates signal propagation, leading to the state of chronic inflammation, are also discussed. [2] To conclude, we propose 2 novel regulatory circuits mediated by miR‐381‐3p in BCa, which may assist in the development of more effective therapies against BCa in the future. [3]암세포는 면역 체크포인트에 의해 매개되는 조절 회로를 가로채어 숙주 면역 시스템의 공격을 피할 수 있습니다. [1] 신호 전파를 조절하여 만성 염증 상태로 이어지는 TLR 활성화에 의해 매개되는 조절 회로도 논의됩니다. [2] 결론적으로, 우리는 BCa에서 miR-381-3p에 의해 매개되는 2개의 새로운 조절 회로를 제안하며, 이는 미래에 BCa에 대한 보다 효과적인 치료법 개발에 도움이 될 수 있습니다. [3]