Protein System(단백질 시스템)란 무엇입니까?
Protein System 단백질 시스템 - It was found that this method could detect the motion mode change in protein systems even when the amplitude change in the collective coordinate was small. [1] This behaviour should be considered for all metal–protein systems, and instrumental techniques – if necessary – should be coupled with modelling to achieve full characterization of the types of binding. [2] Neutron and X-ray reflectometry were used on both single and floating bilayers with the aim of determining the structure and composition of this membrane-protein system before and after protein reconstitution at sub-nanometer resolution. [3] UNRES-Dock protocol was tested on a set of 55 complexes with size from 43 to 587 amino-acid residues, showing that structures of the complexes can be predicted with good quality, if the sampling of the conformational space is sufficient, especially for flexible peptide-protein systems. [4] These results demonstrate the general utility of antibody-based sample simplification for in situ CLMS and greatly expand the scope of protein systems that are amenable to in situ structural studies. [5] Firstly, the injection of ZGO-PEG in a background electrolyte (BGE) containing individual proteins allowed an affinity study to separately characterize each NP-protein system. [6] All the protein systems were inserted into a phospholipid bilayer to characterize the conformational dynamics of the protein using molecular dynamics (MD) simulations. [7] In this work, we show the effectiveness of suitable descriptors calculated along short scaled molecular dynamics runs in recognizing the nearest-native bound conformation among a set of putative structures generated by the HADDOCK tool for eight protein-protein systems. [8] This network of protein associations exhibited clear multiscale and modular structure, revealing 2338 robust assemblies of interacting proteins (hereafter “protein systems”) across different stringencies. [9] Different PCL/protein systems were prepared, and a structural, mechanical and functional characterization was performed. [10] Strong correlations were obtained between predicted and experimental relative binding affinities for both protein-protein systems. [11] Furthermore, the introduction of phosphate groups increased the electronegativity of the protein system, improved the electrostatic repulsion between protein molecules, and made them disperse in the solution system more efficiently. [12] The objectives of current study was to determine protein characteristics, including crude protein fractionation according to the Cornell Net Carbohydrate and Protein System (CNCPS), in situ ruminal crude protein (CP) degradability and Fourier Transformed Infrared Spectroscopy (FTIR), among barley, corn, and sorghum cultivars. [13] Optimal probe:protein systems were further investigated in competitive binding experiments and adapted for high-throughput screening. [14] Altogether, our findings suggest that thiazine rearrangement for N‐terminal cysteine‐maleimide adducts is a general side reaction that is applicable to other peptide or protein systems. [15] Moreover, a set of molecular mechanics (MM) Poisson-Boltzmann (PB) surface area (SA) calculations on the investigated drugs-protein systems were performed and the estimated binding free energy of remdesivir and the apo form of Mpro system was found to be the best. [16] Fluorescence-detected circular dichroism (FDCD) spectroscopy is applied for the first time to supramolecular host–guest and host–protein systems and compared to the more known electronic circular dichroism (ECD). [17] Oleogel was added into the starch-protein system (potato starch: whey protein: water 3:1:5) and 3D printing properties were studied. [18] 2% crude protein with adequate rumen degradable protein but 15% deficient in MP based on estimates by Cornell Net Carbohydrate and Protein System (v6. [19] Protein assemblies in nature are formed via selective association of multiple protein surfaces through intricate noncovalent protein-protein interactions, a challenging task to accurately replicate in the de novo design of multiprotein systems. [20] Here, topological and NCI-based analyses are combined for the multiresolution study of the intermolecular interactions occurring in a drug-protein system (PDB access code: 3UNK). [21] The present study investigated the effects of malic acid, sucrose, and their mixture on the fermentation parameters, Cornell Net Carbohydrate and Protein System (CNCPS) nitrogen fractions, and bacterial community of Moringa oleifera leaves (MOL) silages. [22] The cost of feedstock and the option of convenient technology for efficient fuel production, the availability of commercially viable nanoparticles, a biological understanding of the nanomaterial and protein system, and microorganism compatibility levels involving enzymes and nanomaterials are all discussed repeatedly. [23] Our unifying framework of detection and analysis of spherulite growth can be extended to other protein systems and reveal their aggregation processes at single molecule level. [24] High amount of perchlorate leads to toxicity by inhibiting the iodide uptake in sodium-iodide symporter (NIS) protein system; therefore thyroid hormones can’t be synthesized. [25] This mix contains a significant amount of globulin, which suggests an evident foaming capacity of protein systems and is a positive factor in the technology of making sponge cakes. [26] This approach can be employed with other solute-protein systems and to investigate binding by other drugs or transport proteins directly in clinical samples. [27] Naturally, the interaction between these organisms led to the development of a wonderfully complex set of protein systems used for competition over a once prevalent (but no longer) biocatalytic cofactor. [28] The phenomenon denoted ‘energetic coupling’ describes short- and long-range interactions between two residues in a protein system. [29] The objectives of this study were to investigate effects of steam pressure heating, autoclaving, at 121 °C for 0, 30, 60 and 90 min on changes in carbohydrate chemical profile, the Cornell Net Carbohydrate and Protein System (CNCPS) carbohydrate subfractions, ruminal fermentation characteristics and gas production (GP; in vitro) in relation to changes in carbohydrate molecular structure, of the newly develop Brassica carinata seeds. [30] Our study, for the first time, demonstrates that slowdown of dynamics and preferential exclusion are the principal mechanisms governing trehalose effect on PNIPAM microgels, at odds with preferential adsorption of alcohols, but in full analogy with the behavior observed in trehalose-protein systems. [31] However, glucose induced crowding results in elevated hydration on surfaces of both protein systems. [32] The successful design of binding compounds modulating PPI requires a detailed knowledge of the involved protein-protein system at molecular level, and investigation of the structural motifs that drive the association of the proteins at the recognition interface. [33] Forage crops have been evaluated by the Cornell Net Carbohydrate and Protein System (CNCPS), and the result used as proxy of extractable protein in a biorefinery process. [34] In general, flavonoid loading in protein systems was strongly affected by the combined effects of BSA conformational state (native vs. [35] The effectiveness of our new models is further demonstrated by simulating a metalloprotein system with four force field/water combinations. [36] However, the microscopic mechanisms underlying thermodiffusion in protein systems are poorly understood at this time. [37] The new advances in deep learning methods have influenced many aspects of scientific research, including the study of the protein system. [38] When two or more amino acid mutations occur in protein systems, they can interact in a non-additive fashion termed epistasis. [39] As it stands, OA has not yet been observed for protein systems. [40] This approach can be extended to other chromophore-protein systems where absorption changes reflect dynamic processes of the protein. [41] Mass spectrometry (MS) has emerged as a powerful tool for this purpose, especially for protein systems that are difficult to study by traditional methods. [42] Self recognition proteins may follow the framework of a complex interaction network rather than an isolated two-protein system. [43] In this study, we compare various charge partitioning schemes including fitted charges, density-based quantum mechanical (QM) partitioning schemes, charge equilibration methods, and our recently introduced coarse-grained electron model, C-GeM, to describe the ESP for protein systems. [44] We focused on the metabolic axis—liver endoplasmic reticulum (ER), serum lipoprotein system (Lp) and aorta vessel wall. [45] Under the hypothesis that those natural antioxidants may inhibit the formation of Maillard intermediates, the behavior of several hydroalcoholic plant extracts was analyzed in sugar-protein systems. [46]이 방법은 집합 좌표의 진폭 변화가 작은 경우에도 단백질 시스템의 모션 모드 변화를 감지할 수 있음을 발견했습니다. [1] 이 거동은 모든 금속-단백질 시스템에 대해 고려되어야 하며, 필요한 경우 도구 기술은 결합 유형의 완전한 특성화를 달성하기 위해 모델링과 결합되어야 합니다. [2] 나노미터 미만의 분해능에서 단백질 재구성 전후에 이 막-단백질 시스템의 구조와 구성을 결정하기 위해 단일 및 부동 이중층에 중성자 및 X선 반사 측정법을 사용했습니다. [3] UNRES-Dock 프로토콜은 43개에서 587개 아미노산 잔기의 크기를 가진 55개 복합체 세트에 대해 테스트되었으며, 특히 유연한 펩타이드의 경우 입체 구조 공간의 샘플링이 충분한 경우 복합체의 구조를 우수한 품질로 예측할 수 있음을 보여줍니다. -단백질 시스템. [4] 이러한 결과는 in situ CLMS에 대한 항체 기반 샘플 단순화의 일반적인 유용성을 보여주고 in situ 구조 연구를 수행할 수 있는 단백질 시스템의 범위를 크게 확장합니다. [5] 첫째, 개별 단백질을 포함하는 배경 전해질(BGE)에 ZGO-PEG를 주입하면 친화도 연구가 각 NP-단백질 시스템을 개별적으로 특성화할 수 있습니다. [6] 모든 단백질 시스템은 분자 역학(MD) 시뮬레이션을 사용하여 단백질의 형태 역학을 특성화하기 위해 인지질 이중층에 삽입되었습니다. [7] 이 작업에서 우리는 8개의 단백질-단백질 시스템에 대한 HADDOCK 도구에 의해 생성된 추정 구조 세트 중에서 가장 가까운 기본 결합 형태를 인식하는 데 있어 짧은 규모의 분자 역학 실행을 따라 계산된 적절한 설명자의 효율성을 보여줍니다. [8] 이 단백질 협회 네트워크는 다양한 엄격함에서 상호 작용하는 단백질(이하 "단백질 시스템")의 2338개의 강력한 어셈블리를 나타내는 명확한 다중 규모 및 모듈 구조를 나타냈습니다. [9] 다른 PCL/단백질 시스템을 준비하고 구조적, 기계적 및 기능적 특성화를 수행했습니다. [10] 두 단백질-단백질 시스템에 대해 예측된 상대 결합 친화도와 실험적 상대 결합 친화도 사이에 강한 상관관계가 얻어졌습니다. [11] 또한, 인산기의 도입은 단백질 시스템의 전기 음성도를 증가시키고 단백질 분자 사이의 정전기적 반발력을 향상시키며 용액 시스템에서 보다 효율적으로 분산되도록 하였다. [12] 현재 연구의 목적은 보리, 옥수수 중 Cornell Net Carbohydrate and Protein System(CNCPS)에 따른 조단백질 분획, 제자리 반추위 조단백질(CP) 분해성 및 푸리에 변환 적외선 분광법(FTIR)을 포함한 단백질 특성을 결정하는 것이었습니다. , 수수 품종. [13] 최적의 프로브:단백질 시스템은 경쟁적 결합 실험에서 추가로 조사되었고 고처리량 스크리닝에 적합했습니다. [14] 종합하면, 우리의 연구 결과는 N-말단 시스테인-말레이미드 부가물에 대한 티아진 재배열이 다른 펩티드 또는 단백질 시스템에 적용할 수 있는 일반적인 부반응임을 시사합니다. [15] 또한, 조사된 약물-단백질 시스템에 대한 일련의 분자 역학(MM) Poisson-Boltzmann(PB) 표면적(SA) 계산이 수행되었으며 렘데시비르와 Mpro 시스템의 apo 형태의 추정 결합 자유 에너지는 다음과 같은 것으로 밝혀졌습니다. 최고. [16] 형광 검출 원형 이색성(FDCD) 분광법은 초분자 호스트-게스트 및 호스트-단백질 시스템에 처음으로 적용되었으며 더 잘 알려진 전자 원형 이색성(ECD)과 비교됩니다. [17] Oleogel을 전분-단백질 시스템(감자 전분: 유청 단백질: 물 3:1:5)에 첨가하고 3D 프린팅 특성을 연구했습니다. [18] Cornell Net Carbohydrate and Protein System(v6.6)의 추정치에 따르면 적절한 반추위 분해성 단백질이 포함된 2% 조단백질이지만 MP가 15% 부족합니다. [19] 자연에서 단백질 어셈블리는 복잡한 비공유 단백질-단백질 상호작용을 통해 다중 단백질 표면의 선택적 결합을 통해 형성되며, 이는 다중 단백질 시스템의 새로운 설계에서 정확하게 복제하는 어려운 작업입니다. [20] 여기에서 토폴로지 및 NCI 기반 분석은 약물-단백질 시스템(PDB 액세스 코드: 3UNK)에서 발생하는 분자간 상호작용에 대한 다중 해상도 연구를 위해 결합됩니다. [21] 현재 연구는 발효 매개변수, Cornell Net Carbohydrate and Protein System(CNCPS) 질소 분획, Moringa oleifera 잎(MOL) 사일리지의 박테리아 군집에 대한 말산, 자당 및 이들의 혼합물의 영향을 조사했습니다. [22] 공급원료의 비용과 효율적인 연료 생산을 위한 편리한 기술의 선택, 상업적으로 실행 가능한 나노입자의 가용성, 나노물질 및 단백질 시스템에 대한 생물학적 이해, 효소 및 나노물질과 관련된 미생물 적합성 수준이 모두 반복적으로 논의됩니다. [23] spherulite 성장의 감지 및 분석의 통합 프레임워크는 다른 단백질 시스템으로 확장될 수 있으며 단일 분자 수준에서 응집 과정을 드러낼 수 있습니다. [24] 다량의 과염소산염은 NIS(sodium iodide symporter) 단백질 시스템에서 iodide 흡수를 억제하여 독성을 유발합니다. 따라서 갑상선 호르몬은 합성될 수 없습니다. [25] 이 혼합물에는 상당한 양의 글로불린이 포함되어 있는데, 이는 단백질 시스템의 명백한 발포 능력을 시사하고 스폰지 케이크 제조 기술의 긍정적인 요소입니다. [26] 이 접근법은 다른 용질-단백질 시스템과 함께 사용하고 다른 약물에 의한 결합을 조사하거나 임상 샘플에서 직접 단백질을 수송할 수 있습니다. [27] 당연히, 이러한 유기체 간의 상호 작용은 한때 널리 퍼졌지만 (더 이상은 아닌) 생체 촉매 보조 인자에 대한 경쟁에 사용되는 놀랍도록 복잡한 단백질 시스템 세트의 개발로 이어졌습니다. [28] '에너제틱 커플링'으로 표시된 현상은 단백질 시스템의 두 잔기 사이의 단거리 및 장거리 상호작용을 설명합니다. [29] 이 연구의 목적은 121 °C에서 0, 30, 60 및 90분 동안 증기 압력 가열, 고압멸균이 탄수화물 화학적 프로파일, Cornell Net Carbohydrate and Protein System(CNCPS) 탄수화물 하위 분획, 반추위의 변화에 미치는 영향을 조사하는 것이었습니다. 새로 개발된 브라시카 카리나타 종자의 탄수화물 분자 구조 변화와 관련된 발효 특성 및 가스 생성(시험관 내). [30] 우리의 연구는 처음으로 역학의 감속과 우선적 배제가 PNIPAM 마이크로겔에 대한 트레할로스 효과를 지배하는 주요 메커니즘이며, 알코올의 우선적 흡착과 상충하지만 트레할로스-단백질 시스템에서 관찰되는 행동과 완전히 유사함을 보여줍니다. [31] 그러나 포도당 유도 크라우딩은 두 단백질 시스템의 표면에서 수화를 증가시킵니다. [32] PPI를 조절하는 결합 화합물의 성공적인 설계는 분자 수준에서 관련된 단백질-단백질 시스템에 대한 자세한 지식과 인식 인터페이스에서 단백질의 결합을 유도하는 구조적 모티프에 대한 조사가 필요합니다. [33] 마초 작물은 Cornell Net Carbohydrate and Protein System(CNCPS)에 의해 평가되었으며 그 결과는 바이오리파이너리 공정에서 추출 가능한 단백질의 대용물로 사용되었습니다. [34] 일반적으로 단백질 시스템에서 플라보노이드 로딩은 BSA 형태 상태(네이티브 vs. [35] 우리의 새로운 모델의 효과는 4가지 역장/물 조합으로 금속단백질 시스템을 시뮬레이션함으로써 더욱 입증되었습니다. [36] 그러나, 단백질 시스템에서 열확산의 기초가 되는 미시적 메커니즘은 현재 잘 이해되지 않고 있습니다. [37] 딥 러닝 방법의 새로운 발전은 단백질 시스템 연구를 포함한 과학 연구의 많은 측면에 영향을 미쳤습니다. [38] 두 개 이상의 아미노산 돌연변이가 단백질 시스템에서 발생하면 상위성(epistasis)이라고 하는 비가가적 방식으로 상호작용할 수 있습니다. [39] 그대로 OA는 단백질 시스템에서 아직 관찰되지 않았습니다. [40] 이 접근법은 흡수 변화가 단백질의 동적 과정을 반영하는 다른 발색단-단백질 시스템으로 확장될 수 있습니다. [41] 질량 분석법(MS)은 이러한 목적을 위한 강력한 도구로, 특히 전통적인 방법으로는 연구하기 어려운 단백질 시스템에 사용되었습니다. [42] 자기 인식 단백질은 고립된 두 단백질 시스템보다 복잡한 상호 작용 네트워크의 프레임워크를 따를 수 있습니다. [43] 이 연구에서 우리는 단백질 시스템에 대한 ESP를 설명하기 위해 적합 전하, 밀도 기반 양자 역학(QM) 분할 방식, 전하 평형 방법 및 최근에 도입된 거친 전자 모델인 C-GeM을 포함한 다양한 전하 분할 방식을 비교합니다. . [44] 우리는 대사 축인 간 소포체(ER), 혈청 지단백질 시스템(Lp) 및 대동맥 혈관벽에 초점을 맞췄습니다. [45] 이러한 천연 항산화제가 Maillard 중간체의 형성을 억제할 수 있다는 가설 하에 여러 하이드로알코올성 식물 추출물의 행동을 당-단백질 시스템에서 분석했습니다. [46]
clustered regularly interspaced 정기적으로 간격을 두고 클러스터링됨
The clustered, regularly interspaced, short palindromic repeats‐associated DNA nuclease (CRISPR‐Cas) protein system allows programmable gene editing through inducing double‐strand breaks. [1] Some clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) and CRISPR-associated (Cas) protein systems have been developed to detect nucleic acid with high flexibility, sensitivity and specificity. [2] Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR) and CRISPR-associated (Cas) protein systems have transformed the field of genome editing and transcriptional modulation. [3] These range from random (physical and chemical mutagens) to non-random meganucleases (MegaN), zinc finger nucleases (ZFNs), transcription activator-like effector nucleases (TALENs), clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/associated protein system 9 (CRISPR/Cas9), the CRISPR system from Prevotella and Francisella1 (Cpf1), base editing (BE), and prime editing (PE). [4] Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/CRISPR-associated (Cas) protein system, as an emerging gene editing system, can be divided into class 1 and class 2 systems according to the number of Cas protein. [5] Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPRs)-CRISPR-associated protein systems are bacterial and archaeal defense mechanisms against invading elements such as phages and viruses. [6] Finally, we described recent advance in CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)-Cas (CRISPR associated) protein systems as the most promising biotechnology for large-scale production of ligninolytic enzymes. [7] We created a knockout zebrafish model in which troponin I type 1b (tnnilb) (Tnni‐HC, heart and craniofacial) was deleted using the clustered regularly interspaced short palindromic repeat/clustered regularly interspaced short palindromic repeat‐associated protein system. [8]클러스터링되고 규칙적으로 배치된 짧은 회문 반복 관련 DNA 뉴클레아제(CRISPR-Cas) 단백질 시스템은 이중 가닥 절단을 유도하여 프로그래밍 가능한 유전자 편집을 허용합니다. [1] 높은 유연성, 감도 및 특이성을 가진 핵산을 검출하기 위해 일부 클러스터링된 규칙적으로 간격을 둔 짧은 회문 반복(CRISPR) 및 CRISPR-연관(Cas) 단백질 시스템이 개발되었습니다. [2] nan [3] 이러한 범위는 무작위(물리적 및 화학적 돌연변이원)에서 비무작위 메가뉴클레아제(MegaN), 아연 핑거 뉴클레아제(ZFN), 전사 활성인자 유사 효과기 뉴클레아제(TALEN), 클러스터링된 규칙적으로 간격을 둔 짧은 회문 반복(CRISPR)/관련 단백질 시스템 9에 이르기까지 다양합니다. (CRISPR/Cas9), Prevotella 및 Francisella1의 CRISPR 시스템(Cpf1), 기본 편집(BE) 및 프라임 편집(PE). [4] nan [5] 클러스터된 규칙적으로 간격을 두고 배치된 짧은 회문 반복(CRISPR)-CRISPR 관련 단백질 시스템은 파지 및 바이러스와 같은 침입 요소에 대한 세균 및 고고학적 방어 메커니즘입니다. [6] nan [7] nan [8]
% w w % W w
Furthermore, increasing the proportion of fat replacement to 3% (w/w) in set yoghurt increased the samples hardness while in case of cohesiveness; negative effect was observed because of the action of fat globules within the protein system. [1] Mixed proteins were characterised for their rheological and structural properties at 12% (w/w) total protein concentrations at three mixing ratios (70:30, 50:50 and 30:70) and three pH values (pH 3, 5 and 7), with comparison to the single protein systems. [2] Furthermore, through the use of EDC-NHS chemistry, we demonstrate that members of this eBCL protein system can be covalently cross-linked to fabricate transparent hydrogels with high protein concentrations (at least to 20% w/w). [3] Whey protein systems with varying fat concentrations (WF) of 2, 4, and 6% (w/w) were treated by ultrasound at 20 kHz up to 10 min, which corresponded to energy densities ranging from 9. [4]또한, 세트 요구르트에서 지방 대체 비율을 3%(w/w)로 증가시키면 샘플 경도가 증가하는 반면 응집성의 경우에는 샘플 경도가 증가했습니다. 단백질 시스템 내에서 지방구의 작용으로 인해 부정적인 영향이 관찰되었습니다. [1] 혼합 단백질은 3가지 혼합 비율(70:30, 50:50 및 30:70)과 3가지 pH 값(pH 3, 5 및 7)에서 12%(w/w) 총 단백질 농도에서 유변학적 및 구조적 특성을 특성화했습니다. , 단일 단백질 시스템과 비교. [2] nan [3] 2, 4, 6%(w/w)의 다양한 지방 농도(WF)를 갖는 유청 단백질 시스템은 9에서 에너지 밀도 범위에 해당하는 20kHz에서 최대 10분까지 초음파로 처리되었습니다. [4]
Membrane Protein System 막 단백질 시스템
By employing several microseconds long atomistic molecular dynamics simulation of this trans-membrane protein system, we demonstrate the presence of five distinct water containing pockets/cavities separated by gateways controlled by protein side-chains. [1] From these examples, the integrated MAS and OS-ssNMR approach, in combination with modern computational methods, emerges as a way to overcome the challenges posed by studying large membrane protein systems. [2] Some notable successes in the de novo design of simplified model membrane protein systems have helped articulate fundamental principles of protein folding, architecture and interaction in the hydrophobic lipid environment. [3] In this brief review, we will focus on the overview of the widely used EPR approaches and their emerging applications to answer structural and conformational dynamics related questions on important membrane protein systems. [4] While the field is pushing toward implementing more heterogeneous and realistic membrane compositions, a lack of high-resolution lipidomic data prevents some membrane protein systems from being modeled with the highest level of realism. [5] While the field is pushing towards implementing more heterogeneous and realistic membrane compositions, a lack of high-resolution lipidomic data prevents some membrane protein systems from being modeled with the highest level of realism. [6] Many of the methods discussed here can be applied to other membrane protein systems of interest. [7] Ion mobility-mass spectrometry and collision induced unfolding experiments have recently garnered attention as methods capable of directly detecting and quantifying ligand binding within a wide range of membrane protein systems. [8] Using well-characterized membrane protein systems such as the SecY translocon, the Bam complex and the MetNI transporter, we demonstrate that our dataset is a useful resource for identifying transient and surprisingly novel protein interactions. [9] Next, we apply the quantitative DC z-scan technique to investigate the binding of two peripheral membrane protein systems for which previous z-scan studies failed to detect binding: human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) matrix (MA) protein and lipidation-deficient mutants of the fibroblast growth factor receptor substrate 2α. [10]이 막 횡단 단백질 시스템의 몇 마이크로초 길이의 원자 분자 역학 시뮬레이션을 사용하여 단백질 측쇄에 의해 제어되는 게이트웨이로 분리된 주머니/공동을 포함하는 5개의 별개의 물의 존재를 입증합니다. [1] 이러한 예에서 통합 MAS 및 OS-ssNMR 접근 방식은 현대적인 계산 방법과 결합하여 대형 막 단백질 시스템을 연구함으로써 발생하는 문제를 극복하는 방법으로 등장합니다. [2] nan [3] nan [4] nan [5] nan [6] nan [7] nan [8] nan [9] nan [10]
Model Protein System 모델 단백질 시스템
The purpose of the research is to determine these effects on the model protein systems and to justify the possibility of regulating the technological properties and safety of protein systems by dietary fibers. [1] Using this assay, we quantified shifts in melting temperatures in a heterozygous model protein system, revealing that the thermodynamic stability of wild-type proteins was significantly compromised by the mutant ones but not vice versa. [2] We used a model protein system, peptide self‐assembly mimic (PSAM), which mimics an amyloid‐like structure within a globular protein by capping both edges of single‐layer β sheet (SLB) with certain domains. [3] Lysozyme-thaumatin binary protein mixture was used as the model protein system in this study. [4] We find that all three molecules are effective modifiers of hydration dynamics in solution and all are also effective at protecting model protein systems against thermal denaturation. [5] This dissertation covers four different iron-containing systems: high-valent iron-oxo complexes, nonheme diiron-containing oxygenases, iron-nitrosyl species in model protein system, and heterodinuclear metal complexes. [6]연구의 목적은 모델 단백질 시스템에 대한 이러한 효과를 확인하고 식이 섬유에 의해 단백질 시스템의 기술적 특성과 안전성을 조절할 가능성을 정당화하는 것입니다. [1] 이 분석법을 사용하여 우리는 이형접합 모델 단백질 시스템에서 용융 온도의 변화를 정량화하여 야생형 단백질의 열역학적 안정성이 돌연변이체에 의해 크게 손상되었지만 그 반대의 경우는 아님을 밝혔습니다. [2] nan [3] nan [4] nan [5] nan [6]
Associated Protein System 관련 단백질 시스템
These range from random (physical and chemical mutagens) to non-random meganucleases (MegaN), zinc finger nucleases (ZFNs), transcription activator-like effector nucleases (TALENs), clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/associated protein system 9 (CRISPR/Cas9), the CRISPR system from Prevotella and Francisella1 (Cpf1), base editing (BE), and prime editing (PE). [1] Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPRs)-CRISPR-associated protein systems are bacterial and archaeal defense mechanisms against invading elements such as phages and viruses. [2] We created a knockout zebrafish model in which troponin I type 1b (tnnilb) (Tnni‐HC, heart and craniofacial) was deleted using the clustered regularly interspaced short palindromic repeat/clustered regularly interspaced short palindromic repeat‐associated protein system. [3]이러한 범위는 무작위(물리적 및 화학적 돌연변이원)에서 비무작위 메가뉴클레아제(MegaN), 아연 핑거 뉴클레아제(ZFN), 전사 활성인자 유사 효과기 뉴클레아제(TALEN), 클러스터링된 규칙적으로 간격을 둔 짧은 회문 반복(CRISPR)/관련 단백질 시스템 9에 이르기까지 다양합니다. (CRISPR/Cas9), Prevotella 및 Francisella1의 CRISPR 시스템(Cpf1), 기본 편집(BE) 및 프라임 편집(PE). [1] 클러스터된 규칙적으로 간격을 두고 배치된 짧은 회문 반복(CRISPR)-CRISPR 관련 단백질 시스템은 파지 및 바이러스와 같은 침입 요소에 대한 세균 및 고고학적 방어 메커니즘입니다. [2] nan [3]
Dynamic Protein System 동적 단백질 시스템
This limitation hampers the applicability of XLMS in structural experiments of dynamic protein systems, where less abundant conformers of the target protein are expected in the sample. [1] Functional dynamic protein systems were reconstituted in vitro and their self-organization was observed in response to the 3D geometry. [2] Synopsis Structural studies on partially occupied, dynamic protein systems by crystallography are difficult. [3]이 제한은 동적 단백질 시스템의 구조 실험에서 XLMS의 적용 가능성을 방해하며, 여기서 대상 단백질의 덜 풍부한 컨포머가 샘플에서 예상됩니다. [1] 기능적 동적 단백질 시스템은 시험관 내에서 재구성되었으며 3D 기하학에 대한 응답으로 자체 구성이 관찰되었습니다. [2] nan [3]
Complex Protein System 복합 단백질 시스템
Our approaches thus promise convergent and reliable calculations to examine intuition-based hypotheses and to eventually elucidate the underlying molecular mechanisms of reversible conformational changes in complex protein systems. [1] In such highly complex protein systems, a comprehensive knowledge of fluorescence data is presumed in order to evaluate the specificity of the spectra with respect to a possible detection. [2] 0 may encourage the method's application for large-scale proteomic annotation of complex protein systems. [3]따라서 우리의 접근 방식은 직관 기반 가설을 조사하고 복잡한 단백질 시스템에서 가역적 형태 변화의 기본 분자 메커니즘을 해명하기 위해 수렴적이고 신뢰할 수 있는 계산을 약속합니다. [1] 이러한 고도로 복잡한 단백질 시스템에서는 가능한 검출과 관련하여 스펙트럼의 특이성을 평가하기 위해 형광 데이터에 대한 포괄적인 지식이 있다고 가정합니다. [2] nan [3]
Whey Protein System 유청 단백질 시스템
Whey protein systems with varying fat concentrations (WF) of 2, 4, and 6% (w/w) were treated by ultrasound at 20 kHz up to 10 min, which corresponded to energy densities ranging from 9. [1] 5 wt % whey protein system, coalescence could be suppressed with a coefficient of variation below 20%. [2] The presence of moderate electric fields (MEF) during ohmic heating (OH) treatment of whey protein systems have demonstrated potential to change physicochemical and functional properties, like aggregation rate and extension or viscoelastic behaviour. [3]2, 4, 6%(w/w)의 다양한 지방 농도(WF)를 갖는 유청 단백질 시스템은 9에서 에너지 밀도 범위에 해당하는 20kHz에서 최대 10분까지 초음파로 처리되었습니다. [1] 5wt% 유청 단백질 시스템에서는 20% 미만의 변동 계수로 유착을 억제할 수 있습니다. [2] nan [3]
Simple Protein System
This paper is a description of the workflow we have developed over the course of inferring chemical reaction parameters for a simple protein system, a bacterial cytochrome domain from \textit{Cellvibrio japonicus}. [1] We review here advances in our understanding of how chemical reactions occur at membrane interfaces gleaned with both theoretical and experimental advances using simple protein systems as guides. [2]이 문서는 \textit{Cellvibrio japonicus}의 세균성 사이토크롬 도메인인 단순 단백질 시스템에 대한 화학 반응 매개변수를 추론하는 과정에서 개발한 작업 흐름에 대한 설명입니다. [1] nan [2]
Purified Protein System 정제된 단백질 시스템
Activated protein C inactivates Va and VIIIa in purified protein systems and stimulates fibrinolysis by indirectly increasing the level of circulating plasminogen activator. [1] The effects of elevated Zn2+ alone on fibrin clot density and fibre thickness in a purified protein system were mirrored in samples from T2DM patients, who have derranged NEFA metabolism. [2]활성화된 단백질 C는 정제된 단백질 시스템에서 Va 및 VIIIa를 비활성화하고 순환하는 플라스미노겐 활성화제의 수준을 간접적으로 증가시켜 섬유소 용해를 자극합니다. [1] 정제된 단백질 시스템의 섬유소 응괴 밀도와 섬유 두께에 대한 증가된 Zn2+의 효과는 NEFA 대사가 이상해진 T2DM 환자의 샘플에서 반영되었습니다. [2]
Three Protein System 세 가지 단백질 시스템
We demonstrate the general feasibility of our combined XL-MS/ion mobility approach for three protein systems of increasing complexity: (i) bovine serum albumin (BSA), (ii) Escherichia coli ribosome, and (iii) HEK293T cell nuclear lysates. [1] We demonstrate the general feasibility of our combined XL-MS/ion mobility approach for three protein systems of increasing complexity: (i) Bovine serum albumin, (ii) E. [2]우리는 (i) 소 혈청 알부민(BSA), (ii) 대장균 리보솜 및 (iii) HEK293T 세포 핵 용해물의 복잡성이 증가하는 세 가지 단백질 시스템에 대한 결합된 XL-MS/이온 이동성 접근 방식의 일반적인 가능성을 보여줍니다. [1] 우리는 복잡성이 증가하는 세 가지 단백질 시스템에 대한 결합된 XL-MS/이온 이동성 접근 방식의 일반적인 가능성을 보여줍니다. (i) 소 혈청 알부민, (ii) E. [2]
Established Protein System 단백질 시스템 구축
To probe this for a well-established protein system, we studied the electric-field-driven translocation behavior of cytochrome c (cyt c) through ultrathin silicon nitride (SiNx) solid-state nanopores of diameters ranging from 1. [1] To probe this for a well-established protein system, we studied the electric-field–driven translocation behavior of cytochrome c (cyt c) through ultrathin silicon nitride (SiNx) solid-state nanopores of diameters ranging from 1. [2]잘 정립된 단백질 시스템에 대해 이것을 조사하기 위해 우리는 직경이 1에서 범위인 초박형 질화규소(SiNx) 고체 상태 나노 기공을 통해 사이토크롬 c(cyt c)의 전기장 구동 전위 거동을 연구했습니다. [1] 잘 확립된 단백질 시스템에 대해 이것을 조사하기 위해 우리는 직경이 1에서 범위인 초박형 질화규소(SiNx) 고체 상태 나노 기공을 통한 사이토크롬 c(cyt c)의 전기장 구동 전위 거동을 연구했습니다. [2]
Minde Protein System 기억 단백질 시스템
Here, using a combined experimental and theoretical approach, we discover and describe a hidden function of the Escherichia coli MinDE protein system: in addition to forming dynamic patterns, this system accomplishes the directional active transport of functionally unrelated cargo on membranes. [1] As a paradigm for such pattern formation, the bacterial MinDE protein system is based on self-organization of the ATPase MinD and ATPase-activating protein MinE on lipid membranes. [2]여기에서 결합된 실험 및 이론적 접근 방식을 사용하여 대장균 MinDE 단백질 시스템의 숨겨진 기능을 발견하고 설명합니다. 이 시스템은 동적 패턴을 형성하는 것 외에도 멤브레인에서 기능적으로 관련이 없는 화물의 방향성 능동 수송을 수행합니다. [1] 이러한 패턴 형성의 패러다임으로서, 박테리아 MinDE 단백질 시스템은 지질막 상의 ATPase MinD 및 ATPase 활성화 단백질 MinE의 자가 조직화를 기반으로 합니다. [2]
Min Protein System 최소 단백질 시스템
The Min protein system, found in many rod-shaped bacteria, is thought to play a major role in division site selection. [1] The patterns formed both in vivo and in vitro by the Min protein system have attracted much interest because of the complexity of their dynamic interactions given the apparent simplicity of the component parts. [2]많은 막대 모양의 박테리아에서 발견되는 Min 단백질 시스템은 분열 부위 선택에 중요한 역할을 하는 것으로 생각됩니다. [1] Min 단백질 시스템에 의해 생체 내 및 시험관 내에서 모두 형성된 패턴은 구성 요소의 명백한 단순성을 감안할 때 동적 상호 작용의 복잡성으로 인해 많은 관심을 끌었습니다. [2]
Food Protein System 식품 단백질 시스템
Understanding aggregation in food protein systems is essential to control processes ranging from the stabilization of colloidal dispersions to the formation of macroscopic gels. [1] The data of the bioinformatic approach carried out determined the conditions for subsequent reproduction on real food protein systems. [2]식품 단백질 시스템의 응집을 이해하는 것은 콜로이드 분산의 안정화에서 거시적 겔 형성에 이르는 프로세스를 제어하는 데 필수적입니다. [1] 수행된 생물정보학적 접근의 데이터는 실제 식품 단백질 시스템에서 후속 번식을 위한 조건을 결정했습니다. [2]
S Protein System S 단백질 시스템
We then analyze local protein domain dynamics of the S protein systems and their thermal stability to characterize structural and dynamical variability among them. [1] Our results provide a mechanistic analysis suggesting that the blood and vascular components could be activated directly through S protein systemically present in the circulation and that the activation of the local renin angiotensin system may be partially involved in this process. [2]그런 다음 S 단백질 시스템의 로컬 단백질 도메인 역학과 열 안정성을 분석하여 이들 간의 구조적 및 역학적 가변성을 특성화합니다. [1] 우리의 결과는 혈액 및 혈관 성분이 순환계에 전신적으로 존재하는 S 단백질을 통해 직접 활성화될 수 있고 국소 레닌 안지오텐신 시스템의 활성화가 이 과정에 부분적으로 관여할 수 있음을 시사하는 기계적 분석을 제공합니다. [2]
Milk Protein System 우유 단백질 시스템
This study provides new understanding for the development of anthocyanin-milk protein systems as functional ingredients with health-beneficial properties. [1] The identification and quantification of several human and mammalian milk protein systems and lipid profiles at the group and molecular species level have become a reality, providing useful information for the infant formula industry. [2]이 연구는 건강에 유익한 특성을 가진 기능성 성분으로서 안토시아닌-우유 단백질 시스템의 개발에 대한 새로운 이해를 제공합니다. [1] 그룹 및 분자 종 수준에서 여러 인간 및 포유류 우유 단백질 시스템과 지질 프로필의 식별 및 정량화가 현실이 되어 유아용 조제분유 산업에 유용한 정보를 제공합니다. [2]
Binding Protein System 결합 단백질 시스템
Moreover, CRISPR/Cas technology can be used as an RNA Binding Protein system for molecular biology techniques (such as RNA immunoprecipitation and pull-down), as well as for transcript tracking and live imaging. [1] Expression profiling of 3-week old wild-type (WT) and Csf1rko livers identified 2760 differentially expressed genes associated with the loss of macrophages, severe hypoplasia, delayed hepatocyte maturation, disrupted lipid metabolism and the IGF1/IGF binding protein system. [2]또한, CRISPR/Cas 기술은 분자생물학 기술(예: RNA 면역침전 및 풀다운)과 전사체 추적 및 라이브 이미징을 위한 RNA 결합 단백질 시스템으로 사용할 수 있습니다. [1] 3주 된 야생형(WT) 및 Csf1rko 간의 발현 프로파일링은 대식세포의 손실, 심각한 저형성, 간세포 성숙 지연, 지질 대사 장애 및 IGF1/IGF 결합 단백질 시스템과 관련된 2760개의 차별적으로 발현된 유전자를 확인했습니다. [2]
Different Protein System 다른 단백질 시스템
Intriguingly, several key concepts of pattern formation and regulation apply to a variety of different protein systems. [1] In this publication, we perform a high-throughput study of more than a thousand AFE calculations, utilizing over 220 μs of total sampling time, on three different protein systems to investigate the impact of the initial crystal structure on the resulting binding free energy values. [2]흥미롭게도 패턴 형성 및 조절의 몇 가지 핵심 개념은 다양한 단백질 시스템에 적용됩니다. [1] 이 간행물에서 우리는 3개의 서로 다른 단백질 시스템에서 220μs 이상의 총 샘플링 시간을 활용하여 1,000개 이상의 AFE 계산에 대한 고처리량 연구를 수행하여 결과 결합 자유 에너지 값에 대한 초기 결정 구조의 영향을 조사합니다. [2]
Fusion Protein System 융합 단백질 시스템
The final results indicated that the ZF-Gluc fusion protein system could detect S. [1] Here, we developed an Ebola virus envelope glycoprotein (EboGP)-based chimeric fusion protein system and demonstrated that replacement of the mucin-like domain (MLD) of EboGP with HIV C2-V3-C3 (134 amino acids [aa]) or C2-V3-C3-V4-C4-V5-C5 (243 aa) polypeptides (EbGPΔM-V3 and EbGPΔM-V3-V5, respectively) still maintained the efficiency of EboGP-mediated viral entry into human macrophages and dendritic cells (DCs). [2]최종 결과는 ZF-Gluc 융합 단백질 시스템이 S. [1] 여기에서 우리는 에볼라 바이러스 외피 당단백질(EboGP) 기반 키메라 융합 단백질 시스템을 개발하고 EboGP의 뮤신 유사 도메인(MLD)을 HIV C2-V3-C3(134개 아미노산 [aa]) 또는 C2로 대체하는 것을 입증했습니다. -V3-C3-V4-C4-V5-C5(243 aa) 폴리펩타이드(각각 EbGPΔM-V3 및 EbGPΔM-V3-V5)는 인간 대식세포 및 수지상 세포(DC)로의 EboGP 매개 바이러스 진입 효율을 여전히 유지했습니다. [2]
Fmy Protein System Fmy 단백질 시스템
We present four protein systems with different binding affinity ligands, ranging from nM to high μM. [1] Here, four protein systems (1HOD, 2AJJ, 2DX3, 2RLG) are performed the folding simulation starting from the linear structures in order to investigate their folding mechanisms using the classical molecular dynamics (MD) and the self-guided Langevin dynamics (SGLD), respectively. [2]우리는 nM에서 높은 μM에 이르는 다양한 결합 친화성 리간드를 가진 4개의 단백질 시스템을 제시합니다. [1] 여기에서 4개의 단백질 시스템(1HOD, 2AJJ, 2DX3, 2RLG)이 선형 구조에서 시작하여 접힘 시뮬레이션을 수행하여 고전적 분자 역학(MD) 및 자가 유도 랑주 역학(SGLD)을 사용하여 접는 메커니즘을 조사합니다. 각기. [2]