Protein Interactomes(단백질 인터랙톰)란 무엇입니까?
Protein Interactomes 단백질 인터랙톰 - We hypothesized that genetic determinants for CHDs may lie in protein interactomes of GATA4 and TBX5, two transcription factors that cause CHDs. [1] Additionally, the relevant protein-protein interactomes were also inferred for sub-cellular compartments and expression data were explored under development and biotic stresses namely PAMPs treatment and bacterial infection. [2] We demonstrate substantial overlap in the protein interactomes of three transmembrane Batten proteins (CLN3, CLN6, and CLN8), and that their absence leads to synaptic depletion of key partners (i. [3] We investigated whether mechanisms of oncogenic transformation by NUP98 fusion proteins are hardwired in their protein interactomes. [4] Through the identification of their protein interactomes, both regulatory proteins have been functionally implicated in transcriptional regulation, mRNA metabolism, specifically RNA splicing, the regulation of mRNA stability, especially, in the context of the progesterone hormone response, and the DNA damage response. [5] Generation and visualization of protein interactomes were achieved by the IntAct and Cytoscape softwares, while tertiary protein structures were produced by using the I-TASSER online server. [6] Numerous reagents have been developed to enable chemical proteomic analysis of small molecule-protein interactomes. [7] To elucidate functional characteristics of these N-terminal residues, we compared the protein interactomes of the full-length and ΔPR isoforms of PRDM3 and its closely related paralog, PRDM16. [8] , protein interactomes. [9] es) that provides a comprehensive and curated collection of `protein interactomes’ for more than 1100 organisms, including 30 species with more than 500 interactions, derived from the integration of experimentally detected protein-to-protein physical interactions (PPIs). [10] Numerous reagents have been developed to enable chemical proteomic analysis of small molecule-protein interactomes. [11] However, such simple models can only represent pairwise relationships and cannot fully capture the higher-order organization of protein interactomes, including protein complexes. [12] Through integrative approaches of genome editing, customized-transcriptome profiling and crosslinking-mediated interactome analyses, we discovered that the expression of U2AF1 isoforms is controlled by mTOR and they exhibit a distinctive molecular profile for the splice site and protein interactomes. [13]우리는 CHD에 대한 유전적 결정인자가 CHD를 유발하는 두 가지 전사 인자인 GATA4 및 TBX5의 단백질 상호작용체에 있을 수 있다고 가정했습니다. [1] 또한, 관련 단백질-단백질 상호작용체도 세포하 구획에 대해 추론되었으며 발현 데이터는 개발 및 생물학적 스트레스, 즉 PAMP 처리 및 세균 감염 하에서 탐구되었습니다. [2] 우리는 3개의 막횡단 Batten 단백질(CLN3, CLN6 및 CLN8)의 단백질 상호작용체에서 상당한 중복을 보여주며, 이들의 부재는 주요 파트너의 시냅스 고갈로 이어진다는 것을 보여줍니다(i. [3] 우리는 NUP98 융합 단백질에 의한 발암성 형질전환의 메커니즘이 단백질 상호작용체에 고정되어 있는지 여부를 조사했습니다. [4] 단백질 상호작용체의 확인을 통해 두 조절 단백질 모두 전사 조절, mRNA 대사, 특히 RNA 스플라이싱, 특히 프로게스테론 호르몬 반응의 맥락에서 mRNA 안정성의 조절 및 DNA 손상 반응에 기능적으로 관련되어 있습니다. [5] IntAct 및 Cytoscape 소프트웨어를 사용하여 단백질 상호작용체를 생성하고 시각화했으며, I-TASSER 온라인 서버를 사용하여 3차 단백질 구조를 생성했습니다. [6] 소분자-단백질 상호작용체의 화학적 단백질체 분석을 가능하게 하기 위해 수많은 시약이 개발되었습니다. [7] 이러한 N-말단 잔기의 기능적 특성을 설명하기 위해 우리는 PRDM3의 전장 및 ΔPR 이소형과 그 밀접하게 관련된 파라로그인 PRDM16의 단백질 상호작용체를 비교했습니다. [8] , 단백질 상호작용체. [9] es) 실험적으로 검출된 단백질 대 단백질 물리적 상호 작용(PPI)의 통합에서 파생된 500개 이상의 상호 작용을 가진 30개 종을 포함하여 1100개 이상의 유기체에 대한 포괄적이고 선별된 '단백질 상호 작용체' 컬렉션을 제공합니다. [10] 소분자-단백질 상호작용체의 화학적 단백질체 분석을 가능하게 하기 위해 수많은 시약이 개발되었습니다. [11] 그러나 이러한 간단한 모델은 쌍별 관계만 나타낼 수 있으며 단백질 복합체를 포함한 단백질 상호작용체의 고차 조직을 완전히 포착할 수 없습니다. [12] 게놈 편집, 맞춤형 전사체 프로파일링 및 가교 매개 상호작용체 분석의 통합적 접근을 통해 우리는 U2AF1 이소폼의 발현이 mTOR에 의해 제어되고 스플라이스 부위 및 단백질 상호작용체에 대한 독특한 분자 프로파일을 나타낸다는 것을 발견했습니다. [13]
Specific Protein Interactomes
Summary: The three different isoforms of KIF2A expressed during embryonic corticogenesis have different roles, and proximity ligation proteomics shows the presence of isoform-specific protein interactomes. [1] Here we provide additional insight into the Ras isoform-specific protein interactomes, highlighting new opportunities for unique tumor-type therapies. [2] By combining brain tissue-specific protein interactomes with gene networks, we identified functionally distinct composite clusters of genes that reveal extensive changes in expression levels in AD. [3]요약: 배아 피질 형성 동안 발현되는 KIF2A의 3가지 다른 이소형은 다른 역할을 하며 근접 결찰 단백질체학은 이소형 특이적 단백질 상호작용체의 존재를 보여줍니다. [1] 여기에서 우리는 Ras isoform 특이적 단백질 상호작용체에 대한 추가적인 통찰력을 제공하여 독특한 종양 유형 치료법에 대한 새로운 기회를 강조합니다. [2] 뇌 조직 특이적 단백질 상호작용체를 유전자 네트워크와 결합함으로써, 우리는 AD에서 발현 수준의 광범위한 변화를 드러내는 유전자의 기능적으로 구별되는 복합 클러스터를 식별했습니다. [3]
Host Protein Interactomes 숙주 단백질 인터랙톰
The possible predicted effects of these mutations and co-mutations on the secondary structure of ORF10 variants and host protein interactomes are presented. [1] Integration of the results defined the core and cell-type-specific ncrRNA-host protein interactomes. [2]ORF10 변이체 및 숙주 단백질 인터랙톰의 2차 구조에 대한 이러한 돌연변이 및 공동 돌연변이의 가능한 예측 효과가 제시됩니다. [1] 결과의 통합은 코어 및 세포 유형 특이적 ncrRNA-숙주 단백질 상호작용체를 정의했습니다. [2]
protein interactomes represent 단백질 인터랙톰 대표
An open question is whether the network properties of protein interactomes represent phenotypes under natural selection. [1] An open question is whether the network properties of protein interactomes represent phenotypes under natural selection. [2]열린 질문은 단백질 상호작용체의 네트워크 속성이 자연 선택에서 표현형을 나타내는지 여부입니다. [1] 열린 질문은 단백질 상호작용체의 네트워크 속성이 자연 선택에서 표현형을 나타내는지 여부입니다. [2]