Lysine Demethylases(라이신 탈메틸화효소)란 무엇입니까?
Lysine Demethylases 라이신 탈메틸화효소 - A variety of epigenetic regulators, including histone acetyltransferases (HATs), histone methyltransferases (HMTs) and lysine demethylases (KDMs), are altered in MM, contributing to the disease progression and prognosis. [1] The present study provides the first analysis of the role of the OCT1 transcription factor, associated proteins, and lysine demethylases in mediating responses to anoxia by wood frog tissues. [2] Further study revealed that the expression of lysine demethylases (JMJD1A, JMJD1B, JMJD1C, and KDM6B) was significantly reduced in Prmt5-deficient SSCs and that the level of permissive arginine methylation H3R2me2s was significantly decreased at the upstream promoter region of these genes in Prmt5-deficient SSCs. [3] A major group of enzymes that influence epigenetic modifications are lysine demethylases (KDMs) also known as “erasers” which remove methyl groups on lysine (K) amino acids of histones. [4] This post-translational modification is regulated by lysine methyltransferases and lysine demethylases. [5] The metabolites inhibit the lysine demethylases, KDM4A/B, causing aberrant hypermethylation of H3K9 and disrupting signaling at the break, thereby delaying the stepwise recruitment of key HDR factors. [6] METHODS We studied the molecular-clinical correlations of epigenetic modifiers including bromodomains, histone acetyltransferases, lysine methyltransferases and lysine demethylases in HCC using The Cancer Genome Atlas (TCGA) data of 365 patients with HCC. [7] In breast cancer, Lysine-specific demethylase-1 (LSD1) and other lysine demethylases (KDMs), such as Lysine-specific demethylase 6A also known as Ubiquitously transcribed tetratricopeptide repeat, X chromosome (UTX), are co-expressed and co-localize with estrogen receptors (ERs), suggesting the potential use of hybrid (epi)molecules to target histone methylation and therefore regulate/redirect hormone receptor signaling. [8] RNA-seq analysis of 5% oxygen hPSC also indicated increases in glycolysis, lysine demethylases, and glucose-derived carbon metabolism, while increased methyltransferase and cell cycle activity was indicated at 20% oxygen. [9] Furthermore, many epigenetic drugs have a great potential in cancer therapy, including histone methyltransferases, lysine demethylases, histone deacetylasesand, bromodomain and extra-terminal domain proteins and DNA methyltransferases inhibitors. [10]히스톤 아세틸트랜스퍼라제(HAT), 히스톤 메틸트랜스퍼라제(HMT) 및 라이신 데메틸라제(KDM)를 포함한 다양한 후성 유전적 조절인자가 MM에서 변경되어 질병 진행 및 예후에 기여합니다. [1] 현재의 연구는 나무 개구리 조직에 의한 무산소 반응을 매개하는 OCT1 전사 인자, 관련 단백질 및 라이신 데메틸라제의 역할에 대한 첫 번째 분석을 제공합니다. [2] 추가 연구에 따르면 라이신 탈메틸화효소(JMJD1A, JMJD1B, JMJD1C 및 KDM6B)의 발현이 Prmt5 결핍 SSC에서 유의하게 감소되었고 허용 아르기닌 메틸화 H3R2me2s의 수준이 Prmt5에서 이들 유전자의 상류 프로모터 영역에서 유의하게 감소되었다는 것이 밝혀졌습니다. 부족한 SSC. [3] 후성 유전적 변형에 영향을 미치는 주요 효소 그룹은 히스톤의 라이신(K) 아미노산에 있는 메틸기를 제거하는 "지우개"로도 알려진 라이신 데메틸라제(KDM)입니다. [4] 이 번역 후 변형은 라이신 메틸트랜스퍼라제 및 라이신 데메틸라제에 의해 조절됩니다. [5] 대사 산물은 라이신 탈메틸화 효소인 KDM4A/B를 억제하여 H3K9의 비정상적인 과메틸화를 유발하고 중단 시 신호 전달을 방해하여 주요 HDR 인자의 단계적 모집을 지연시킵니다. [6] 행동 양식 우리는 간세포암종 환자 365명의 TCGA(The Cancer Genome Atlas) 데이터를 사용하여 간세포암종에서 브로모도메인, 히스톤 아세틸트랜스퍼라제, 라이신 메틸트랜스퍼라제 및 라이신 데메틸라제를 포함한 후성유전적 변형자의 분자-임상 상관관계를 연구했습니다. [7] 유방암에서 라이신 특이적 디메틸라제-1(LSD1) 및 기타 라이신 디메틸라제(KDM), 예를 들어 유비쿼터스 전사된 테트라트리코펩티드 반복, X 염색체(UTX)라고도 알려진 라이신 특이적 디메틸라제 6A는 공동 발현되고 공동 국소화됩니다. 에스트로겐 수용체(ER)와 함께, 히스톤 메틸화를 표적으로 하고 따라서 호르몬 수용체 신호전달을 조절/리디렉트하기 위한 하이브리드(epi) 분자의 잠재적인 사용을 시사합니다. [8] 5% 산소 hPSC의 RNA-seq 분석은 또한 해당 작용, 라이신 데메틸라제 및 포도당 유래 탄소 대사의 증가를 나타내었으며, 20% 산소에서 증가된 메틸트랜스퍼라제 및 세포 주기 활성을 나타내었습니다. [9] 또한, 히스톤 메틸트랜스퍼라제, 라이신 데메틸라제, 히스톤 데아세틸라제, 브로모도메인 및 말단외 도메인 단백질 및 DNA 메틸트랜스퍼라제 억제제를 비롯한 많은 후성유전 약물은 암 치료에 큰 잠재력을 가지고 있습니다. [10]
Histone Lysine Demethylases 히스톤 라이신 데메틸라제
Cancer pathogenesis involves epigenetic dysregulation and in particular, histone lysine demethylases (KDMs) have been implicated in TKI resistance. [1] Summary Histone lysine demethylases (KDMs) play critical roles in oncogenesis and therefore may be effective targets for anticancer therapy. [2] Interestingly, the three Lepto lines overexpressed Jumonji domain–containing histone lysine demethylases KDM4A/4C. [3] Jumonji C (JmjC) domain proteins are histone lysine demethylases that require ferrous iron and alpha-ketoglutarate (or α-KG) as cofactors in the oxidative demethylation reaction. [4] Histone lysine demethylases (KDMs) play a vital role in regulating chromatin dynamics and transcription. [5] We found that intermittent hypoxia increases HIF-1 activity through a pathway distinct from chronic hypoxia, involving the KDM4A, -B and -C histone lysine demethylases. [6] Jumanji C (JmjC)-containing histone lysine demethylases (JmjC-KDMs) are coactivators of HIF-1-dependent transcriptional activation. [7] In particular, methylation and demethylation of specific lysine residues alter gene accessibility via histone lysine methyltransferases (KMTs) and histone lysine demethylases (KDMs). [8] Histone lysine demethylases (KDM) are responsible for histone demethylation and are involved in gene expression regulation. [9] Histone lysine demethylases (KDM) have emerged recently as new potential drug targets for HNSCC therapy. [10] We further found that VLX600 and other iron chelators disrupt HR, in part, by inhibiting iron-dependent histone lysine demethylases (KDM) family members, thus blocking recruitment of HR repair proteins, including RAD51, to double-strand DNA breaks. [11] Development of castration resistant prostate cancer (CRPC) requires androgen-independent activation of AR, which involves its large N-terminal domain (NTD) and entails dramatic epigenetic changes depending in part on histone lysine demethylases (KDMs) that interact with AR. [12] 3105 Background: The KDM4 family of histone lysine demethylases consists of four main isoforms (KDM4A, B, C, D), all of which have been identified as key oncogenic drivers. [13] The most potent cytotoxic active compounds 5, 7e and 7i presented inhibitory activity against KDM (histone lysine demethylases) with IC50 = 4. [14] We herein report that DFP chelates the Fe2+ ion at the active sites of selected iron-dependent histone lysine demethylases (KDMs), resulting in pan inhibition of a subfamily of KDMs. [15] Here, putative histone lysine demethylases (Kdm) and methyltransferases (Kmt) were identified in an isogenic lineage of the self-fertilizing hermaphroditic vertebrate, the mangrove rivulus fish, Kryptolebias marmoratus. [16] Although various epigenetic regulator families, such as DNA methyltransferases, ten-eleven translocation proteins, histone acetyltransferases, histone deacetylases, BET bromodomain proteins, protein arginine methyltransferases, histone lysine methyltransferases, and histone lysine demethylases, have a role in diverse cancers, specific members have a function in HNSCC. [17] KDM4/JMJD2 Jumonji C-containing histone lysine demethylases (KDM4A–D) constitute an important class of epigenetic modulators in the transcriptional activation of cellular processes and genome stability. [18] Histone lysine demethylases (KDMs) have drawn much attention as targets of therapeutic agents. [19] Histone lysine demethylases (KDMs) are involved in the dynamic regulation of gene expression and they play a critical role in several biological processes. [20] Mutant IDHs convert α-ketoglutarate (α-KG) to 2-hydroxyglutarate (2-HG), which affects the activity of multiple α-KG-dependent dioxygenases including histone lysine demethylases. [21] The epigenetic regulators include writers, such as DNA methyltransferases (DNMTs); histone acetyltransferases (HATs) and histone lysine methyltransferases; erasers, such as histone deacetylases (HDACs); histone lysine demethylases [e. [22] ABSTRACT There is growing evidence that histone lysine demethylases (KDMs) play critical roles in the regulation of embryo development. [23] Histone deacetylases (SIRT1 and HDAC2), histone lysine demethylases (KDM3A and LSD1) and histone lysine methyltransferases (SET7 and SMYD1) were significantly regulated by DOX treatment with generation of cleaved protein fragments and posttranslational modifications. [24] Two independent studies from Science report that hypoxia causes histone hypermethylation by direct modulation of histone lysine demethylases. [25] This review discusses the involvement of histone lysine demethylases in the development of resistance to TKI and highlights the importance to develop new cancer treatment regimens to counteract this phenomenon. [26] In addition, we closely analyzed the improperly expressed histone lysine methyltransferases and histone lysine demethylases during cell reprogramming in cloned embryos. [27] ABSTRACT Potential functional coordination between histone deubiquitinases and histone lysine demethylases represents one of the least studied aspects of epigenetic control of transcriptional outcomes. [28] In the present study, we examined the effects of downregulation of H3K9me3 with ETP69 and upregulation of H3K9me3 with NCDM-32B, an inhibitor of histone lysine demethylases 4, on key molecules associated with synaptic plasticity in primary cultures of hippocampal neurons and hippocampi of aged mice. [29] Gene expression and tumor growth can be regulated by methylation levels of lysine residues on histones, which are controlled by histone lysine demethylases (KDMs). [30] Histone methylation is catalyzed by histone lysine methyltransferases (HKMT) and histone demethylation by histone lysine demethylases. [31] Background Jumonji domain-containing protein 2A (JMJD2A), belonging to the JMJD2 family of histone lysine demethylases, has been implicated in tumorigenesis. [32] Histone lysine demethylases (KDMs) are emerging as therapeutic targets in cancer. [33] The JmjC domain-containing proteins, an important family of histone lysine demethylases, play a vital role in maintaining homeostasis of histone methylation in vivo. [34] Background Jumonji domain-containing protein 2A (JMJD2A) of the JMJD2 family of histone lysine demethylases has been implicated in tumorigenesis. [35] In this regard, histone lysine demethylases (KDMs) are now emerging as key players that shape chromatin through their ability to demethylate almost all major histone methylation sites. [36]암 발병 기전은 후성 유전적 조절 장애를 포함하며 특히 히스톤 라이신 데메틸라제(KDM)는 TKI 내성과 관련이 있습니다. [1] 요약 Histone lysine demethylases(KDMs)는 종양 형성에 중요한 역할을 하므로 항암 치료의 효과적인 표적이 될 수 있습니다. [2] 흥미롭게도 3개의 Lepto 계통은 Jumonji 도메인을 포함하는 히스톤 라이신 데메틸라제 KDM4A/4C를 과발현했습니다. [3] Jumonji C(JmjC) 도메인 단백질은 산화적 탈메틸화 반응에서 보조인자로서 제1철 및 알파-케토글루타레이트(또는 α-KG)를 필요로 하는 히스톤 라이신 탈메틸화효소입니다. [4] 히스톤 라이신 탈메틸화효소(KDM)는 염색질 역학 및 전사를 조절하는 데 중요한 역할을 합니다. [5] 우리는 간헐적 저산소증이 KDM4A, -B 및 -C 히스톤 라이신 탈메틸화효소를 포함하는 만성 저산소증과는 다른 경로를 통해 HIF-1 활성을 증가시킨다는 것을 발견했습니다. [6] Jumanji C(JmjC)-함유 히스톤 라이신 demethylases(JmjC-KDMs)는 HIF-1 의존적 전사 활성화의 coactivators입니다. [7] 특히, 특정 라이신 잔기의 메틸화 및 탈메틸화는 히스톤 라이신 메틸트랜스퍼라제(KMT) 및 히스톤 라이신 데메틸라제(KDM)를 통한 유전자 접근성을 변경합니다. [8] 히스톤 라이신 탈메틸화효소(KDM)는 히스톤 탈메틸화를 담당하고 유전자 발현 조절에 관여합니다. [9] Histone lysine demethylases(KDM)는 최근 HNSCC 치료를 위한 새로운 잠재적인 약물 표적으로 등장했습니다. [10] 우리는 또한 VLX600 및 기타 철 킬레이터가 부분적으로 철 의존성 히스톤 라이신 데메틸라제(KDM) 계열 구성원을 억제하여 이중 가닥 DNA 파손에 대한 RAD51을 포함한 HR 복구 단백질의 모집을 차단함으로써 HR을 방해한다는 것을 발견했습니다. [11] 거세 저항성 전립선암(CRPC)의 발달은 AR의 안드로겐-독립적 활성화를 필요로 하며, 이는 큰 N-말단 도메인(NTD)을 포함하고 AR과 상호작용하는 히스톤 라이신 데메틸라제(KDM)에 부분적으로 의존하는 극적인 후성 유전적 변화를 수반합니다. [12] 3105 배경: 히스톤 라이신 탈메틸화효소의 KDM4 계열은 4가지 주요 동형(KDM4A, B, C, D)으로 구성되며, 이들 모두는 주요 발암성 동인으로 확인되었습니다. [13] 가장 강력한 세포독성 활성 화합물 5, 7e 및 7i는 IC50=4인 KDM(히스톤 라이신 데메틸라제)에 대한 억제 활성을 나타냈다. [14] 우리는 여기에서 DFP가 선택된 철 의존성 히스톤 라이신 데메틸라제(KDM)의 활성 부위에서 Fe2+ 이온을 킬레이트화하여 KDM의 서브패밀리의 팬 억제를 초래한다고 보고합니다. [15] 여기에서 추정되는 히스톤 라이신 데메틸라제(Kdm) 및 메틸트랜스퍼라제(Kmt)는 자가 수정 자웅동체 척추동물인 맹그로브 리불루스 물고기인 Kryptolebias marmoratus의 동종 계통에서 확인되었습니다. [16] DNA 메틸트랜스퍼라제, 텐-일레븐 전위 단백질, 히스톤 아세틸트랜스퍼라제, 히스톤 데아세틸라제, BET 브로모도메인 단백질, 단백질 아르기닌 메틸트랜스퍼라제, 히스톤 라이신 메틸트랜스퍼라제 및 히스톤 라이신 데메틸라제와 같은 다양한 후성 조절 인자 패밀리가 다양한 암에서 역할을 하지만 특정 구성원은 HNSCC의 기능. [17] KDM4/JMJD2 Jumonji C-함유 히스톤 라이신 데메틸라제(KDM4A-D)는 세포 과정의 전사 활성화 및 게놈 안정성에서 중요한 부류의 후성유전 조절인자를 구성합니다. [18] Histone lysine demethylases(KDMs)는 치료제의 표적으로 많은 관심을 받아왔다. [19] 히스톤 라이신 데메틸라제(KDM)는 유전자 발현의 동적 조절에 관여하며 여러 생물학적 과정에서 중요한 역할을 합니다. [20] 돌연변이 IDH는 α-케토글루타레이트(α-KG)를 2-하이드록시글루타레이트(2-HG)로 전환시키며, 이는 히스톤 라이신 데메틸라제를 비롯한 여러 α-KG 의존성 디옥시게나제의 활성에 영향을 미칩니다. [21] 후성적 조절인자는 DNA 메틸트랜스퍼라제(DNMT)와 같은 작성자; 히스톤 아세틸트랜스퍼라제(HAT) 및 히스톤 라이신 메틸트랜스퍼라제; 히스톤 데아세틸라제(HDAC)와 같은 지우개; 히스톤 라이신 데메틸라제[e. [22] 요약 히스톤 라이신 탈메틸화효소(KDM)가 배아 발달 조절에 중요한 역할을 한다는 증거가 늘어나고 있습니다. [23] 히스톤 데아세틸라제(SIRT1 및 HDAC2), 히스톤 라이신 데메틸라제(KDM3A 및 LSD1) 및 히스톤 라이신 메틸트랜스퍼라제(SET7 및 SMYD1)는 절단된 단백질 단편의 생성 및 번역 후 변형과 함께 DOX 처리에 의해 유의하게 조절되었습니다. [24] Science의 두 가지 독립적인 연구에 따르면 저산소증은 히스톤 라이신 탈메틸화효소의 직접적인 조절에 의해 히스톤 과메틸화를 유발합니다. [25] 이 리뷰는 TKI에 대한 내성 발달에 히스톤 라이신 데메틸라제가 관여하는 것에 대해 논의하고 이 현상을 상쇄하기 위한 새로운 암 치료 요법을 개발하는 것의 중요성을 강조합니다. [26] 또한, 우리는 복제된 배아에서 세포 재프로그래밍 동안 부적절하게 발현된 히스톤 라이신 메틸트랜스퍼라제와 히스톤 라이신 데메틸라제를 면밀히 분석했습니다. [27] 요약 histone deubiquitinases와 histone lysine demethylases 사이의 잠재적인 기능적 조정은 전사 결과의 후성 유전적 제어에 대해 가장 적게 연구된 측면 중 하나를 나타냅니다. [28] 현재 연구에서 우리는 ETP69에 의한 H3K9me3의 하향 조절 및 히스톤 라이신 데메틸라제 4의 억제제인 NCDM-32B에 의한 H3K9me3의 상향 조절이 나이든 마우스의 해마 뉴런 및 해마의 1차 배양에서 시냅스 가소성과 관련된 핵심 분자에 미치는 영향을 조사했습니다. . [29] 유전자 발현 및 종양 성장은 히스톤 라이신 탈메틸화효소(KDM)에 의해 제어되는 히스톤의 라이신 잔기의 메틸화 수준에 의해 조절될 수 있습니다. [30] 히스톤 메틸화는 히스톤 라이신 메틸트랜스퍼라제(HKMT)에 의해 촉매되고 히스톤 메틸화는 히스톤 라이신 데메틸라제에 의해 촉매됩니다. [31] 배경 히스톤 라이신 데메틸라제의 JMJD2 계열에 속하는 Jumonji 도메인 함유 단백질 2A(JMJD2A)는 종양 형성과 관련이 있습니다. [32] 히스톤 라이신 데메틸라제(KDM)는 암의 치료 표적으로 부상하고 있습니다. [33] 히스톤 라이신 탈메틸화효소의 중요한 패밀리인 JmjC 도메인 함유 단백질은 생체 내에서 히스톤 메틸화의 항상성을 유지하는 데 중요한 역할을 합니다. [34] 배경 히스톤 라이신 데메틸라제의 JMJD2 계열의 Jumonji 도메인 함유 단백질 2A(JMJD2A)는 종양 형성과 관련이 있습니다. [35] 이와 관련하여, 히스톤 라이신 탈메틸화효소(KDM)는 거의 모든 주요 히스톤 메틸화 부위를 탈메틸화하는 능력을 통해 염색질을 형성하는 핵심 역할자로 부상하고 있습니다. [36]
Methyl Lysine Demethylases
The KDM7 subfamily of enzymes - PHF8 (KDM7B) and KIAA1718 (KDM7A) are human JmjC 2OG-dependent Nε-methyl lysine demethylases and are involved in demethylation of lysine residues in histones such as H3K27me2/1, H3K9me2/1 and H4K20me1. [1] The human KDM7 subfamily histone H3 Nϵ-methyl lysine demethylases PHF8 (KDM7B) and KIAA1718 (KDM7A) have different substrate selectivities and are linked to genetic diseases and cancer. [2]효소의 KDM7 서브패밀리 - PHF8(KDM7B) 및 KIAA1718(KDM7A)은 인간 JmjC 2OG 의존성 Nε-메틸 라이신 탈메틸화효소이며 H3K27me2/1, H3K9me20me 및 H. [1] 인간 KDM7 서브패밀리 히스톤 H3 Nϵ-메틸 라이신 데메틸라제 PHF8(KDM7B) 및 KIAA1718(KDM7A)은 기질 선택성이 다르며 유전 질환 및 암과 관련이 있습니다. [2]
Dependent Lysine Demethylases
GDH1 degradation reduces intracellular αKG levels by more than half and decreases the activity of αKG‐dependent lysine demethylases (KDMs). [1] Fe(II)/α-ketoglutarate-dependent lysine demethylases (KDMs) are attractive drug targets for several diseases including cancer. [2]GDH1 분해는 세포 내 αKG 수준을 절반 이상 감소시키고 αKG 의존성 라이신 데메틸라제(KDM)의 활성을 감소시킵니다. [1] Fe(II)/α-케토글루타레이트 의존성 라이신 데메틸라제(KDM)는 암을 포함한 여러 질병에 대한 매력적인 약물 표적입니다. [2]