Known Viruses
알려진 바이러스

6개의 바이러스 종에 속하는 9개의(거의) 완전한 게놈이 확인되었으며 모두 알려진 바이러스와 밀접하게 관련되어 있습니다.

여기에서 우리는 고고생 사상성 바이러스를 선형 A형 이중 가닥 DNA 게놈 및 다른 알려진 바이러스에 의해 암호화된 것과 관련이 없는 특징적인 주요 캡시드 단백질과 통합하는 새로운 영역인 Adnaviria의 생성을 발표합니다.

2020); 둘째, 바이러스 뉴클레오티드 서열의 주석은 특히 알려진 바이러스와 상동성이 없거나 전혀 없는 경우 여전히 도전적입니다(Roux et al.

제안된 기술(BPINF)을 사용하는 FLAT는 COVID-19 외에 거대한 길이의 실제 생물학적 시퀀스 세트와 다른 잘 알려진 바이러스 사이의 LCCS를 감지하는 것으로 검증되었습니다.

그러나 바이롬 데이터는 대부분 알려지지 않은 바이러스로 구성되어 있어 분석이 어렵다.

SARS-CoV-2와 다른 바이러스 인자 간의 분자(비)유사성을 특성화하면 알려진 바이러스로 인한 주요 생물학적 과정의 변경에 대한 기존 정보를 활용하여 이 새로운 바이러스의 잠재적 영향을 예측할 수 있습니다.

최근 몇 년 동안 생물정보학적 분석과 결합된 Next Generation Sequencing은 식물 샘플에서 알려진 바이러스와 알려지지 않은 바이러스를 식별하기 위해 널리 채택되었습니다.

알려진 바이러스의 알려지지 않은 숙주를 식별하여 이 그림을 완성하는 것은 동물 저장소에서 인간 인구로의 유출과 같은 인수공통전염병 및 동물 질병 위험을 식별하고 완화하는 데 도움이 될 수 있는 중요한 연구 목표입니다.

6,700만 개의 알려지지 않은 바이러스 중 약 631,000~827,000개의 알려지지 않은 바이러스가 인간을 감염시킬 수 있는 능력을 가지고 있습니다.

HTS와 RT-PCR에 의한 알려진 바이러스의 탐지는 서로 거의 유사합니다.

qPCR에 의한 PPV2 양성 샘플의 1/3에서 메타게놈 시퀀싱에 의해 다른 알려진 바이러스가 확인되지 않았습니다.

또한, 우리는 발견된 박쥐 SARSr-CoV-2 계통의 알려진 바이러스 중 천산갑 유래 SARSr-CoV-2 또는 SARSr-CoV-1 계통의 일부 바이러스만큼 효율적으로 인간 ACE2를 사용하지 않는다는 것을 보여주었습니다.

현재 연구에서 우리는 GenBank에 플라스미드로 기탁된 Bacillus cereus 그룹 종에서 23개의 게놈을 확인했으며 알려진 바이러스와 상동성이 거의 또는 전혀 없는 플라스미드 프로파지에 속할 수 있습니다.

이 연구에서 우리는 연어 숙주 전사 바이오마커를 적용하여 바이러스성 질병 상태에 있는 물고기를 식별하고 선택하지만 RT-PCR 스크리닝을 기반으로 알려진 바이러스에 대해 음성인 물고기만 선택했습니다.

결과는 이러한 박화과 감염 바이러스의 지리적 범위가 더 확장되었음을 나타냅니다. 그러나 플로리다에서 더 오래 탐지되지 않은 존재는 알려진 바이러스에 기인한 관련 증상과 유사하기 때문에 그럴듯합니다.

대부분의 바이러스 관련 contig는 사과 줄기 홈 가공 바이러스(ASGV) 및 사과 줄기 구멍 바이러스(ASPV)를 포함하여 알려진 바이러스의 서열과 일치했습니다.

SARS-CoV-2(시험관 내)에서도 알려진 모든 바이러스에 관계없이 23% 농도.

이 연구에서는 알려진 바이러스와 알려지지 않은 바이러스를 검출할 수 있는 바이러스 검출 방법(VIDISCA-next generation sequencing)을 사용하여 질병의 서로 다른 시점에서 47명의 CIDP 환자의 혈청 및 가능한 경우 뇌척수액의 바이롬을 분석했습니다. (CSF) 샘플(N: 17).

본 연구에서는 유인원 거품 바이러스, 푸스틴 바이러스 및 크림-콩고 출혈열 오르토나이로바이러스가 다양한 샘플에서 검출되었으며, 모든 샘플에서 바이러스 군집의 10-30% 이상이 알려지지 않은 바이러스로 구성되어 있습니다.

463%) 판독은 알려진 바이러스에 대해 상당한 서열 동일성을 보여주었습니다.

동물을 감염시키는 대부분의 알려진 바이러스는 숙주 세포에 들어가기 위해 세포내이입 경로를 탐색하지만, Nucleocytoviricota 문을 구성하는 다양한 고대 바이러스 그룹은 세포의 세포질에 대한 새로운 접근 경로를 탐색하기 위해 진화한 것으로 보입니다.

차세대 시퀀싱(NGS)은 알려진 바이러스와 알려지지 않은 바이러스를 탐지하고 특성화할 수 있지만 산탄총 메타게노믹스 시퀀싱과 같은 편견 없는 접근 방식을 사용할 경우 감도가 제한됩니다.

또한, 우리는 박쥐 SARSr-CoV-2 계통 또는 지금까지 발견된 새로운 계통에서 알려진 바이러스 중 천산갑의 SARSr-CoV-2 또는 일부 SARSr-CoV-1 계통 바이러스와 비교하여 인간 ACE2를 효율적으로 사용하지 않는다는 것을 보여줍니다. .

배경 목표 혈소판 농축액(PC)은 이식을 위한 1차 인간 세포를 확장하기 위해 성장 배지의 인간 혈소판 용해물(HPL) 보충제를 준비하기 위해 풀링됩니다. 이것은 알려지거나, 새로 출현하고, 알려지지 않은 바이러스에 의한 오염의 위험을 증가시킵니다.

그러나 최근에 알려진 모든 바이러스에 대한 포괄적인 연구는 수행되지 않았습니다(즉, 사용 가능한 모든 서열에 대해).

꿀벌 개체군에 영향을 미치는 알려진 바이러스 중 하나는 기형 날개 바이러스(DWV)입니다.

이 연구의 목적은 유라시아 툰드라 순록에서 알려진 바이러스와 이전에 알려지지 않은 바이러스를 탐지하는 것이었습니다.

우리의 연구 결과는 이전에 알려지지 않은 바이러스를 포함하는 케냐 갯지렁이들 사이에서 다양한 RNA 바이롬을 보여줍니다.

우리는 알려진 바이러스에 대해 28%-40% 아미노산 동일성을 보여주는 5개의 새로운 바이러스를 식별했습니다.

새로운 분리주는 계통 발생학적으로 다양하며 일부는 알려진 바이러스와 함께 클러스터링되지만 다른 것들은 분기된 새로운 클러스터를 형성하는 것으로 보입니다.

그러나 바이롬 데이터는 대부분 알려지지 않은 바이러스로 구성되어 있어 분석이 어렵다.

게놈은 알려진 바이러스와 거의 유사하지 않습니다(BLASTn).

신열대 지역은 알려지지 않은 바이러스의 숙주이자 근거리 매개체 역할을 할 수 있는 상당히 다양한 조류 종의 서식처입니다.

세 가지 바이러스 모두 다른 토끼 라고바이러스와 가장 밀접하게 관련되어 있었지만 알려진 바이러스 및 서로 간에 계통발생학적으로 구별되어 라고바이러스가 이전에 가정된 것보다 더 오랫동안 순환했음을 나타냅니다.

실험 결과에 따르면 SBD 방식은 대부분의 악성코드(알려진 바이러스만)를 탐지하여 제거했습니다.

총 62,508개의 새로운 조립 contig가 구성되었으며 BLAST 검색 결과 3600개(≥300 nt)가 바이러스 서열과 관련이 있는 것으로 나타났습니다. 바이러스와 코로나바이러스.

다만, 미지의 바이러스를 검출하거나 검체 내의 모든 바이러스를 보고하는 것이 목적인 경우에는 고순도 검체가 필요합니다.

알려진 바이러스를 안정적으로 탐지하고 NGS 데이터에서 새로운 변종 바이러스를 발견하려면 민감하고 정확한 전용 분석 도구가 필요합니다.

이 연구에서는 긴꼬리땅다람쥐(Spermophilus undulatus) 배설물에서 고처리량 염기서열 분석을 통해 알려지지 않은 바이러스의 배출을 조사했습니다.

우리는 Baakal 바이러스(BKAV)와 Lakamha 바이러스(LAKV)로 지정된 이전에 알려지지 않은 두 가지 바이러스를 식별하고 특성화했습니다.

제1형 당뇨병에 대한 유전적 위험이 높은 어린 아동의 대변 샘플에서 알려진 바이러스 분석은 독립적인 단기 EV-B 감염보다 지속적인 엔테로바이러스 B(EV-B) 감염이 섬의 발달에 관여할 수 있음을 보여줍니다 자가면역이지만 제1형 당뇨병은 아닙니다.

야생 식물 개체군에는 무수히 많은 알려지지 않은 바이러스가 있을 수 있습니다.

표면 강화 라만 분광법과 함께 다중 바이러스 캡처 구성 요소를 통해 다양한 신흥 균주(또는 알려지지 않은 바이러스)를 강화하고 실시간으로 식별할 수 있습니다.

임상적 중요성에도 불구하고 매우 다양하거나 아직 알려지지 않은 바이러스의 탐지는 주요 도전과제입니다.

이 환경에서 분리된 haloarchaeal 바이러스의 게놈에 대한 메타게놈 서열의 매핑은 이러한 알려진 바이러스가 사용 가능한 바이롬에서 과소 대표된다는 것을 보여주었습니다.

거의 52개의 완전한 바이러스 게놈 염기서열이 회수되었으며, 그 중 16개는 알려진 바이러스와 상동성을 보였고 36개는 Potyvirus, Comovirus, Tombusvirus(RNA 바이러스), Begomovirus 및 Mastrevirus(DNA 바이러스)를 포함한 다른 속과 유사성을 공유했습니다.

다른 metagenomic 전략과 유사하게, dsRNA-Seq는 알려진 바이러스와 거의 또는 전혀 유사성을 공유하지 않는 알려지지 않은 바이러스 질병 인자를 식별할 가능성이 있습니다.

전반적으로, 이 작업은 주요 매개변수를 강조하고 알려진 바이러스와 알려지지 않은 바이러스의 신뢰할 수 있는 sRNA 기반 검출을 위한 권장 사항을 제안합니다.

알려지지 않은 새로운 바이러스의 식별 및 특성화는 매우 중요합니다.

그러나 대부분의 바이롬 분석은 알려진 바이러스의 제한된 부분에 대해 수행되었습니다.

매년 3억 7000만 명이 넘는 사람들이 사이버 범죄에 희생되고1 수만 개의 알려진 바이러스가 존재하기 때문에 보안에 대한 위협은 현실이지만 온라인 인권에 대한 위협도 마찬가지입니다.

알려진 바이러스에 대한 서열 유사성으로 분류되지 않은 나머지 비숙주 RNA 어셈블리는 작은 RNA 프로필로 클러스터링되었으며 39개의 고품질 독립 contig가 바이러스 복제 중간체의 고전적인 RNAi 처리 패턴과 강력하게 일치하여 완전히 설명되지 않은 바이러스임을 시사합니다.

표적 탐지 방법은 알려지지 않은 바이러스를 탐지하는 능력이 제한적이며 종종 동시 감염을 탐지하거나 항원 변이체를 식별하기에 불충분한 데이터를 제공합니다.

GFP-양성 제브라피쉬의 RNA 시퀀싱은 알려진 바이러스와 거리가 먼 피코르나바이러스를 밝혀냈습니다.

회사는 알려진 모든 위협을 사전에 예방하고 안정적으로 만들기 때문에 소프트웨어가 완벽하게 안전하다고 생각합니다. 이 구현에서는 알려진 바이러스와 버그가 제공되지 않습니다.

이전 연구에서 새로운 LCDV 종의 게놈인 LCDV-Sa가 이전에 알려지지 않은 2개의 바이러스인 Sparus aurata papillomavirus 1(SaPV1) 및 Sparus aurata polyomavirus 1(SaPyV1)과 함께 검출되었습니다.

임상적 중요성에도 불구하고 매우 다양하거나 아직 알려지지 않은 바이러스의 탐지는 주요 도전과제입니다.