Genome Wide Identification(게놈 전체 식별)란 무엇입니까?
Genome Wide Identification 게놈 전체 식별 - However, conventional approaches for genome-wide identification of TE insertion sites are costly and laborious. [1] In this review, we summarize recent milestones in characterizing the human genetic basis of DNA methylation variation over the last decade, including heritability findings and genome-wide identification of meQTLs. [2] DrugCHIPER-CS as a computational approach can speed the genome-wide identification of drug target on jamu formula efficiently. [3] As detailed in this report, the data generated from both genome-wide identification and expression analysis of lipoxygenase genes suggest the putative functions of two 13-LOXs ( SbLOX9 and SbLOX5 ) and three 9-LOXs ( SbLOX1, SbLOX3, and SbLOXo ) in biosynthesis of jasmonic acid, green leaf volatiles and death acids, and all of them are involved in defense-related functions in plants. [4] Currently, genome-wide identification of non-coding regulatory elements is an active area of research with significant progress made in humans, mice, and other model organisms. [5] Genome-wide identification and characterization of MITEs provide essential information for understanding genome structure and evolution. [6] In the present study, comprehensive analyses, including genome-wide identification, phylogeny, conserved domain/motif, gene structure, chromosomal location, subcellular localization, gene duplication, and expression patterns of the SOCS gene family in grass carp, were performed, based on genomic and transcriptomic data. [7] At present, a comprehensive investigation into the genome-wide identification and classification of MADS-box genes in foxtail millet (Setaria italica L. [8] Conclusions: This study provides the genome-wide identification and functional characterization of lncRNAs associated with 20E-induced autophagy in the fat body of B. [9] OBJECTIVE: Current work aims for a genome-wide identificationof CAD family and its expression correlation with fruit firmness in strawberry varieties. [10] Here, we performed genome-wide identification and comparative analysis of flowering-time genes in three palnt families i. [11] Genome-wide identification of regulatory elements (REs) responsible for regulating gene activity is key to further mechanistic studies. [12] This study was aimed at the genome-wide identification, a comprehensive in silico characterization of NHX genes from soybean ( Glycine max L. [13] Existing experimental methods are time-consuming and expensive, highlighting the need for computational approaches to accelerate the genome-wide identification of enhancers. [14] MAIN CONCLUSION Genome-wide identification, expression analysis of the MYC family in Camellia sinensis, and potential functional characterization of CsMYC2. [15] Upscaled high-throughput versions of CAGE have enabled the genome-wide identification of transcription start sites, including transcriptionally active promoters and enhancers. [16] In this study, we conducted genome-wide identification and characterization of OR genes in the snow leopard and compared them to all other Panthera species. [17] Whereas most studies of TGLs have focused on seed oil metabolism and biofuel in plants, limited information is available regarding the genome-wide identification and characterization of the TGL gene family in tomato (Solanum lycopersicum L. [18] Conclusion As NAC genes are known to play role in several physiological and biological activities, a more comprehensive study on genome-wide identification and expression analyses of the NAC proteins have been carried out in chickpea, pigeonpea and groundnut. [19] Summary Translation initiation site (TIS) profiling allows for the genome-wide identification of TISs in vivo by exclusively capturing mRNA fragments within ribosomes that have just completed translation initiation. [20] MAIN CONCLUSION Genome-wide identification reveals 55 PvuGRAS genes belonging to 16 subfamilies and their gene structures and evolutionary relationships were characterized. [21] Therefore, genome-wide identification of MITE insertions can help to shed light on their copy number variation and genome insertion features. [22] In this paper, to gain more insights into the regulatory mechanism of miRNAs in apple fruit ripening, a genome-wide identification of the sRNAome was implemented in the postharvest ‘Qinguan’ apple fruit. [23] Though many omics approaches have been employed to study in planta survival strategies, the direct genome-wide identification of R. [24] We performed genome-wide identification and expression analysis of the STP gene family to investigate the STPSs’ potential roles in the growth of wheat seedlings under stress. [25] The development of high throughput genetic tools is needed to dissect the function of multigene families, targeting several genes in a specific pathway, and finally genome-wide identification of essential genes to find novel drug targets. [26] Overall, genome-wide identification approach was used to further analyze the related functions of the RF gene family, which may include the response to drought stress, in cotton. [27] Here, we performed genome-wide identification and evolutionary analysis of the REM gene family in Rosaceae. [28] Results Here, we have performed a genome-wide identification of FCS-like zinc finger (FLZ) proteins and assessed their involvement in submergence response in rice. [29] The transcription factor Scleraxis (Scx) is expressed throughout tendon development and plays essential roles in both embryonic tendon development and adult tendon healing, but few direct target genes of Scx in tendon development have been reported and genome-wide identification of Scx direct target genes in vivo has been lacking. [30] A genome-wide identification and expression analysis of multidrug and toxic compound extrusion (MATE) gene family in potato was carried out to explore the response of MATE proteins to heavy meta stress. [31] We used genome-wide identification, phylogenetic analysis, chromosomal distribution and collinearity to examine potential functions of Lhc superfamily genes in upland cotton. [32] The genome-wide identification and expression analysis of genes related to the branched-chain amino acids (BCAA) synthesis pathway were carried out. [33] Results: In this study, genome-wide identification was carried out on G-type lectin gene family in Fragaria vesca. [34] Several bioinformatic tools have been developed for genome-wide identification of orthologous and paralogous genes. [35] Results To investigate the roles played by the AHL gene family in soybean, genome-wide identification, expression patterns and gene structures were performed to analyze. [36] Further, genome-wide identification of OsLEC1 binding sites demonstrated that OsLEC1 directly bound to genes involved in photosynthesis, photomorphogenesis, as well as abscisic acid (ABA) and gibberellin (GA) pathways, in seed maturation. [37] Various studies have demonstrated multiple cellular functions of Hsps in living organisms as an important biomarker in response to abiotic and biotic stressors, however, full genome-wide identification of Hsps, particularly in aquatic invertebrates, has not been reported. [38] In this study, the genome-wide identification of SOD genes and their expression patterns under abiotic stresses has been done in watermelon and melon. [39] The genome-wide identification of TaNRAMP1 (natural resistance-associated macrophage protein 1), known as high-affinity Mn transporter, showed several polymorphisms within genome A, B, and D. [40] In this study, we characterized 37 VrDIR genes in mungbean using a genome-wide identification method. [41] Genome-wide identification and expression analysis of SLAC/SLAH gene family members were performed in B. [42] The PYL gene family has been identified and analyzed in many species, however, there is no report about the research on the whole genome-wide identification of the alfalfa (Medicago sativa L. [43] In this study, we have carried out genome-wide identification and bioinformatics characterization of basic leucine zipper domain proteins (bZIPs) from cultivated cotton species Gossypium hirsutum along with two sub-genome species of allotetraploid cotton, Gossypium arboreum and Gossypium raimondii. [44] Herein, our study aimed to perform a genome-wide identification of the PUT gene family in C. [45] The current experimental methods provide a genome-wide identification of epigenetic modifications; however, they are expensive and time-consuming. [46] aralocaspica and comparatively analyze their expression and regulation patterns as well as the biochemical and enzymatic properties in this study, we characterized a bacterial-type PEPC (BTPC; SaPEPC-4) in addition to the two plant-type PEPCs (PTPCs; SaPEPC-1 and SaPEPC-2) using a genome-wide identification. [47] Thus, a comprehensive genome-wide identification analysis was performed to identify HSFs in the maize genome. [48] Here, we performed genome-wide identification of heat shock protein 70 family in the silkworm, Bombyx mori. [49] An accurate and reliable genome-wide identification of 6mA sites is crucial for systematically understanding its biological functions. [50]그러나, TE 삽입 부위의 게놈 전체 식별을 위한 기존의 접근 방식은 비용과 노력이 많이 듭니다. [1] 이 검토에서 우리는 유전 가능성 발견 및 meQTL의 전체 게놈 식별을 포함하여 지난 10년 동안 DNA 메틸화 변이의 인간 유전적 기초를 특성화하는 최근 이정표를 요약합니다. [2] DrugCHIPER-CS는 컴퓨터 접근 방식으로 Jamu 공식에서 약물 표적의 게놈 전체 식별을 효율적으로 가속화할 수 있습니다. [3] 이 보고서에 자세히 설명된 것처럼 리폭시게나제 유전자의 게놈 전체 식별 및 발현 분석에서 생성된 데이터는 생합성에서 2개의 13-LOX(SbLOX9 및 SbLOX5)와 3개의 9-LOX(SbLOX1, SbLOX3 및 SbLOXo)의 추정 기능을 제안합니다. jasmonic acid, green leaf volatiles, death acid 등으로 구성되어 있으며 모두 식물의 방어기능에 관여한다. [4] 현재, 비암호화 조절 요소의 게놈 전체 식별은 인간, 마우스 및 기타 모델 유기체에서 상당한 진전이 이루어진 활발한 연구 영역입니다. [5] MITE의 게놈 전체 식별 및 특성화는 게놈 구조 및 진화를 이해하는 데 필수적인 정보를 제공합니다. [6] 본 연구에서는 풀 잉어에서 SOCS 유전자 패밀리의 게놈 전체 식별, 계통 발생, 보존된 도메인/모티프, 유전자 구조, 염색체 위치, 세포 내 위치, 유전자 복제 및 발현 패턴을 포함한 포괄적인 분석을 수행했습니다. 게놈 및 전사체 데이터. [7] 현재, 여우꼬리 기장(Setaria italica L. [8] 결론: 이 연구는 B. 지방체에서 20E로 유도된 자가포식과 관련된 lncRNA의 게놈 전체 식별 및 기능적 특성화를 제공합니다. [9] 목적: 현재 작업은 CAD 가족의 게놈 전체 식별 및 딸기 품종의 과일 경도와의 발현 상관 관계를 목표로 합니다. [10] 여기에서 우리는 3개의 palnt 가족 i에서 개화 시기 유전자의 게놈 전체 식별 및 비교 분석을 수행했습니다. [11] 유전자 활성 조절을 담당하는 조절 요소(RE)의 게놈 전체 식별은 추가 역학 연구의 핵심입니다. [12] 이 연구는 대두의 NHX 유전자(Glycine max L. [13] 기존 실험 방법은 시간이 많이 걸리고 비용이 많이 들기 때문에 인핸서의 게놈 전체 식별을 가속화하기 위한 컴퓨터 접근 방식의 필요성을 강조합니다. [14] 주요 결론 전체 게놈 식별, Camellia sinensis에서 MYC 계열의 발현 분석 및 CsMYC2의 잠재적 기능적 특성화. [15] CAGE의 확장된 고처리량 버전은 전사 활성 프로모터 및 인핸서를 포함하여 전사 시작 부위의 게놈 전체 식별을 가능하게 했습니다. [16] 이 연구에서 우리는 눈표범에서 OR 유전자의 게놈 전체 식별 및 특성화를 수행하고 다른 모든 Panthera 종과 비교했습니다. [17] TGL에 대한 대부분의 연구는 식물의 종자유 대사 및 바이오 연료에 초점을 맞추었지만 토마토의 TGL 유전자 패밀리의 게놈 전체 식별 및 특성화에 관한 정보는 제한적입니다(Solanum lycopersicum L. [18] 결론 NAC 유전자는 여러 생리학적 및 생물학적 활동에 역할을 하는 것으로 알려져 있으므로 병아리콩, 비둘기, 땅콩에서 NAC 단백질의 게놈 전체 식별 및 발현 분석에 대한 보다 포괄적인 연구가 수행되었습니다. [19] 요약 번역 개시 부위(TIS) 프로파일링은 번역 개시를 완료한 리보솜 내에서 mRNA 단편만을 독점적으로 포획함으로써 생체내 TIS의 게놈 전체 식별을 허용합니다. [20] 주요 결론 게놈 전체의 식별은 16개의 서브패밀리에 속하는 55개의 PvuGRAS 유전자를 보여주고 이들의 유전자 구조와 진화적 관계가 특성화되었습니다. [21] 따라서 MITE 삽입의 게놈 전체 식별은 복제 수 변이 및 게놈 삽입 기능을 밝히는 데 도움이 될 수 있습니다. [22] 이 논문에서는 사과 과일 숙성에서 miRNA의 조절 메커니즘에 대한 더 많은 통찰력을 얻기 위해 수확 후 'Qinguan' 사과 과일에서 sRNAome의 게놈 전체 식별을 구현했습니다. [23] 많은 omics 접근법이 식물 생존 전략 연구에 사용되었지만 R. [24] 우리는 스트레스 하에서 밀 묘목의 성장에서 STPS의 잠재적 역할을 조사하기 위해 STP 유전자 패밀리의 게놈 전체 식별 및 발현 분석을 수행했습니다. [25] 다중 유전자 패밀리의 기능을 분석하고, 특정 경로의 여러 유전자를 표적화하고, 마지막으로 새로운 약물 표적을 찾기 위한 필수 유전자의 전체 게놈 식별을 위해서는 처리량이 많은 유전 도구의 개발이 필요합니다. [26] 전반적으로, 면화에서 가뭄 스트레스에 대한 반응을 포함할 수 있는 RF 유전자 패밀리의 관련 기능을 추가로 분석하기 위해 게놈 전체 식별 접근법이 사용되었습니다. [27] 여기에서 우리는 장미과에서 REM 유전자 패밀리의 게놈 전체 식별 및 진화 분석을 수행했습니다. [28] 결과 여기에서 우리는 FCS-유사 징크 핑거(FLZ) 단백질의 게놈 전체 식별을 수행하고 쌀에서의 침수 반응에 대한 이들의 관련성을 평가했습니다. [29] 전사 인자 Scleraxis(Scx)는 힘줄 발달 전반에 걸쳐 발현되며 배아 힘줄 발달과 성인 힘줄 치유 모두에서 필수적인 역할을 하지만, 힘줄 발달에서 Scx의 직접적인 표적 유전자는 거의 보고되지 않았으며 Scx 직접 표적 유전자의 게놈 전체 식별은 다음과 같습니다. 생체가 부족했습니다. [30] 다중 약물 및 독성 화합물 압출(MATE) 유전자 패밀리의 게놈 전체 식별 및 발현 분석은 무거운 메타 스트레스에 대한 MATE 단백질의 반응을 조사하기 위해 수행되었습니다. [31] 우리는 고지대 목화에서 Lhc 슈퍼패밀리 유전자의 잠재적 기능을 조사하기 위해 게놈 전체 식별, 계통 발생 분석, 염색체 분포 및 공선성을 사용했습니다. [32] 분지쇄 아미노산(BCAA) 합성 경로와 관련된 유전자의 게놈 전체 식별 및 발현 분석을 수행했습니다. [33] 결과: 이 연구에서는 Fragaria vesca에서 G형 렉틴 유전자 패밀리에 대한 전체 게놈 식별을 수행했습니다. [34] 이종 상동 및 유사 유전자의 게놈 전체 식별을 위해 여러 생물 정보학 도구가 개발되었습니다. [35] 결과 대두에서 AHL 유전자 패밀리가 수행하는 역할을 조사하기 위해 전체 게놈 식별, 발현 패턴 및 유전자 구조를 분석하기 위해 수행되었습니다. [36] 또한, OsLEC1 결합 부위의 게놈 전체 식별은 OsLEC1이 종자 성숙에서 광합성, 광형성, 앱시스산(ABA) 및 지베렐린(GA) 경로에 관여하는 유전자에 직접 결합한다는 것을 입증했습니다. [37] 다양한 연구에서 비생물적 및 생물학적 스트레스 요인에 대한 중요한 바이오마커로서 살아있는 유기체에서 Hsps의 다중 세포 기능이 입증되었지만, 특히 수생 무척추동물에서 Hsps의 전체 게놈 전체 식별은 보고되지 않았습니다. [38] 이 연구에서는 수박과 멜론에서 SOD 유전자와 비 생물적 스트레스 하에서의 발현 패턴의 게놈 전체 식별이 수행되었습니다. [39] 고친화성 Mn 트랜스포터로 알려진 TaNRAMP1(자연 저항 관련 대식세포 단백질 1)의 게놈 전체 식별은 게놈 A, B 및 D 내에서 여러 다형성을 보여주었습니다. [40] 이 연구에서 우리는 게놈 전체 식별 방법을 사용하여 녹두에서 37 VrDIR 유전자를 특성화했습니다. [41] SLAC/SLAH 유전자 패밀리 구성원의 게놈 전체 식별 및 발현 분석은 B. [42] PYL 유전자 패밀리는 많은 종에서 확인 및 분석되었지만 알팔파(Medicago sativa L. [43] 이 연구에서 우리는 동종사배체 목화, Gossypium arboreum 및 Gossypium raimondii의 두 하위 게놈 종과 함께 재배된 목화 종 Gossypium hirsutum에서 기본 류신 지퍼 도메인 단백질(bZIP)의 게놈 전체 식별 및 생물 정보학 특성화를 수행했습니다. [44] 여기에서 우리의 연구는 C에서 PUT 유전자 패밀리의 게놈 전체 식별을 수행하는 것을 목표로 했습니다. [45] 현재의 실험적 방법은 후생유전학적 변형에 대한 게놈 차원의 식별을 제공합니다. 그러나 비용이 많이 들고 시간이 많이 걸립니다. [46] aralocaspica와 이 연구에서 이들의 발현 및 조절 패턴과 생화학적 및 효소적 특성을 비교 분석하여, 우리는 두 가지 식물형 PEPC(PTPC, SaPEPC-1) 외에 박테리아형 PEPC(BTPC, SaPEPC-4)를 특성화했습니다. 및 SaPEPC-2) 전체 게놈 식별을 사용합니다. [47] 따라서 옥수수 게놈에서 HSF를 식별하기 위해 포괄적인 게놈 전체 식별 분석을 수행했습니다. [48] 여기에서 우리는 누에인 Bombyx mori에서 열 충격 단백질 70 패밀리의 게놈 전체 식별을 수행했습니다. [49] 6mA 사이트의 정확하고 신뢰할 수 있는 전체 게놈 식별은 생물학적 기능을 체계적으로 이해하는 데 중요합니다. [50]