Conformational Switching(구조적 스위칭)란 무엇입니까?
Conformational Switching 구조적 스위칭 - For eventual deployment as viable sub-nanoscale components that are compatible with current electronic device technology, conformational switching should be controllable by a local electric field (i. [1] SAXS coupled to atomic structures enables integrated structural biology for objective quantitative assessment of conformational ensembles and assemblies in solution, intra‐molecular distances, structural similarity, functional disorder, conformational switching, and flexibility. [2] The Z/E photoisomerization of the azobenzene moiety of MUJs induces rolling in/out conformational switching of the azobenzene-bearing side-ring and consequently leads to planar chirality switching of MUJs. [3] The triad follows different emissive routes ranging from phosphorescence to TADF based on the conformational switching of the D units. [4] M-WEM is tested on the Müller-Brown potential model, the conformational switching in alanine dipeptide, and the millisecond timescale protein-ligand unbinding in a trypsin-benzamidine complex. [5] Disordered regions are linked to posttranslational modifications, conformational switching, extra/intracellular trafficking, and allosteric control, among other phenomena. [6] A control peptide lacking the metal-coordinating residues does not show conformational switching with Zn 2+ supporting the role of this metal in stabilizing the β-sheet conformation in a defined manner. [7] Our study reveals mechanistic principles of ATP binding, conformational switching, and energy transduction for substrate transport of ABC export systems. [8] As such, these findings provide a molecular basis for both conformational switching and kinetic control. [9] These systems have been used to model the conformational switching of proteins as they cycle from an inactive state in the cell cytoplasm, to an active state at the cell membrane. [10] The circular dichroism study unravels the conformational switching from mixed hybrid to parallel structure for the short sequence of human telomeric G-quadruplex structure in the presence of both the ligands. [11] The holistic regulatory networks orchestrated by phytochromes, including conformational switching, subcellular localization, direct protein-protein interactions, transcriptional and posttranscriptional regulations, and translational and posttranslational controls to promote photomorphogenesis, are highly coordinated and regulated at multiple levels. [12] We then quantitatively predict the ultrasensitivity and performance of multivalent-encoded protein logic gates, evaluate the inherent programmability of multispecificity for selective receptor targeting, and extract rate constants of conformational switching for the SARS-CoV-2 spike protein and model its binding to ACE2 as well as multivalent inhibitors of this interaction. [13] There is no shortage of small molecule-binding aptamers; however, only a small fraction of them are suitable for RNA engineering since a classical SELEX protocol selects only for high-affinity binding but not for conformational switching. [14] 2 μs simulations with a focus on physicochemical, structural and dynamic properties reveal that T11S-ANG, N26K-RNASE4 and T79A-RNASE4 variants would result in loss of ribonucleolytic activity due to conformational switching of catalytic His114 and His116 respectively but none of the variants would lose their nuclear translocation activity. [15] Conformational switching of the benzothiazole hydrazone derivatives of complexes 2 and 5 from trans (E) to cis (Z) are observed on treatment with sodium azide. [16] This results in simple design rules that allow a single DNA nanostructure to reproduce multiple membrane protein functions: peripheral anchoring, nanopore behavior, and conformational switching to reveal membrane-binding units. [17] GLUT1 works through conformational switching from an outward-open (OOP) to an inward-open (IOP) conformation passing through an occluded conformation. [18] A label-free fluorescence aptasensor based on conformational switching of aptamer induced by Cd2+ was established for the good selective determination of Cd2+. [19] Conformational switching between such structures is a key element of protein folding and aggregation. [20] Phosphorylation of DrRecA at Y77 (tyrosine 77) and T318 (threonine 318) residues modifies the structural and conformational switching that impart the efficiency and activity of DrRecA. [21] Real-space observation of conformational switching of the hexamer induced by inelastic electrons is achieved by using a low-temperature scanning tunneling microscopy with molecular resolution. [22] The fluorescence anisotropy was proposed for the study of conformational switching of the i-motif structure for tC-probes in the presence and absence of a complementary sequence. [23] We thus demonstrate the value of the helical peptoid, which provided a controlled orientation for 7-MF and porphyrin and modulated the energy transfer efficiency via conformational switching. [24]현재 전자 장치 기술과 호환되는 실행 가능한 나노 크기 미만 구성 요소로 최종 배포하려면 구조적 전환이 로컬 전기장(i. [1] 원자 구조와 결합된 SAXS는 용액의 구조 앙상블 및 어셈블리, 분자 내 거리, 구조적 유사성, 기능 장애, 구조 전환 및 유연성의 객관적인 정량적 평가를 위한 통합 구조 생물학을 가능하게 합니다. [2] MUJ의 아조벤젠 부분의 Z/E 광이성체화는 아조벤젠 함유 측륜의 롤링 인/아웃 형태 전환을 유도하고 결과적으로 MUJ의 평면 키랄성 전환으로 이어집니다. [3] 트라이어드는 D 단위의 형태 전환을 기반으로 인광에서 TADF에 이르는 다양한 방출 경로를 따릅니다. [4] M-WEM은 뮐러-브라운 전위 모델, 알라닌 디펩티드의 구조 전환 및 트립신-벤즈아미딘 복합체의 밀리초 시간 규모 단백질-리간드 결합 해제에 대해 테스트됩니다. [5] 무질서한 영역은 다른 현상 중에서 번역 후 수정, 형태 전환, 세포외/세포내 인신매매 및 알로스테릭 제어와 연결되어 있습니다. [6] 금속-배위 잔기가 결여된 대조군 펩티드는 β-시트 형태를 정의된 방식으로 안정화하는 데 있어 이 금속의 역할을 지원하는 Zn 2+와 형태 전환을 나타내지 않는다. [7] 우리의 연구는 ABC 수출 시스템의 기질 수송을 위한 ATP 결합, 형태 전환 및 에너지 변환의 기계적 원리를 보여줍니다. [8] 따라서 이러한 발견은 형태 전환 및 운동 제어 모두에 대한 분자 기반을 제공합니다. [9] 이러한 시스템은 세포질의 비활성 상태에서 세포막의 활성 상태로 순환할 때 단백질의 구조적 전환을 모델링하는 데 사용되었습니다. [10] 원형 이색성 연구는 두 리간드가 모두 존재할 때 인간 텔로머 G-사중체 구조의 짧은 시퀀스에 대한 혼합 하이브리드에서 병렬 구조로의 구조적 전환을 풉니다. [11] 형태 전환, 세포 내 위치, 직접적인 단백질-단백질 상호 작용, 전사 및 전사 후 규정, 광형 형성을 촉진하기 위한 번역 및 번역 후 제어를 포함하여 피토크롬에 의해 조정되는 전체적 규제 네트워크는 여러 수준에서 고도로 조정되고 규제됩니다. [12] 그런 다음 다가 인코딩된 단백질 논리 게이트의 초감도 및 성능을 정량적으로 예측하고, 선택적 수용체 표적화를 위한 다중특이성의 고유한 프로그래밍 가능성을 평가하고, SARS-CoV-2 스파이크 단백질에 대한 형태 전환의 속도 상수를 추출하고 ACE2에 대한 결합을 다음과 같이 모델링합니다. 뿐만 아니라 이 상호작용의 다가 억제제. [13] 소분자 결합 앱타머는 부족하지 않습니다. 그러나 고전적인 SELEX 프로토콜은 고친화성 결합만 선택하고 형태 전환에는 선택하지 않기 때문에 그 중 작은 부분만 RNA 엔지니어링에 적합합니다. [14] 물리화학적, 구조적 및 동적 특성에 초점을 맞춘 2μs 시뮬레이션은 T11S-ANG, N26K-RNASE4 및 T79A-RNASE4 변이체가 각각 촉매 His114 및 His116의 구조적 전환으로 인해 리보핵분해 활성의 손실을 초래하지만 변이체 중 어느 것도 그들의 핵 전위 활동을 잃습니다. [15] 트랜스(E)에서 시스(Z)로의 복합체 2 및 5의 벤조티아졸 히드라존 유도체의 구조적 전환은 아지드화 나트륨 처리 시 관찰됩니다. [16] 그 결과 단일 DNA 나노구조가 여러 막 단백질 기능을 재현할 수 있는 간단한 설계 규칙이 생성됩니다. [17] GLUT1은 폐쇄형 구조를 통과하는 외부 개방(OOP)에서 내부 개방(IOP) 구조로의 구조 전환을 통해 작동합니다. [18] Cd2+에 의해 유도된 앱타머의 구조적 전환에 기반한 무표지 형광 앱타센서는 Cd2+의 우수한 선택적인 결정을 위해 확립되었습니다. [19] 이러한 구조 사이의 구조적 전환은 단백질 접힘 및 응집의 핵심 요소입니다. [20] Y77(티로신 77) 및 T318(트레오닌 318) 잔기에서 DrRecA의 인산화는 DrRecA의 효율성과 활성을 부여하는 구조 및 형태 전환을 수정합니다. [21] 분자 분해능이 있는 저온 주사 터널링 현미경을 사용하여 비탄성 전자에 의해 유도된 6량체의 형태 전환을 실제 공간에서 관찰할 수 있습니다. [22] 형광 이방성은 상보적 서열의 존재 및 부재하에 tC-프로브에 대한 i-모티프 구조의 구조적 스위칭 연구를 위해 제안되었습니다. [23] 따라서 우리는 7-MF 및 포르피린에 대한 제어된 방향을 제공하고 형태 전환을 통해 에너지 전달 효율을 조절하는 나선형 펩토이드의 값을 보여줍니다. [24]
Dependent Conformational Switching
We discuss here the strategy for combining site-selective labeling with various spectroscopic methods to characterize structural and thermodynamic aspects of protonation-dependent conformational switching and membrane insertion of the diphtheria toxin T-domain. [1] However, the installation of a protonation-dependent conformational switching mechanism resolved the problem because it enabled a highly selective and relatively polar molecule to access a small population of a conformer with lower polar surface area and higher membrane permeability. [2]우리는 여기에서 양성자 의존적 형태 전환 및 디프테리아 독소 T-도메인의 막 삽입의 구조적 및 열역학적 측면을 특성화하기 위해 다양한 분광 방법과 사이트 선택적 라벨링을 결합하기 위한 전략에 대해 논의합니다. [1] 그러나 양성자화 의존적 형태 전환 메커니즘을 설치하면 선택성이 높고 상대적으로 극성인 분자가 더 낮은 극성 표면적과 더 높은 막 투과성을 갖는 소수의 정합체에 접근할 수 있기 때문에 문제가 해결되었습니다. [2]
Induced Conformational Switching 유도된 형태적 스위칭
A colorimetric biosensor assay has been developed for Cd2+ and Hg2+ detection based on Cd2+-dependent DNAzyme cleavage and Hg2+-binding-induced conformational switching of the G-quadruplex fragment. [1] The structural constraints imposed by the two tethering interactions, combined with phosphorylation-induced conformational switching of 4E-BP1, explain the hierarchy of 4E-BP1 phosphorylation by mTORC1. [2]Cd2+ 의존성 DNA자임 절단 및 G-quadruplex 단편의 Hg2+ 결합 유도 구조 전환에 기반한 Cd2+ 및 Hg2+ 검출을 위한 비색 바이오센서 분석이 개발되었습니다. [1] 4E-BP1의 인산화 유도 구조 전환과 결합된 두 개의 테더링 상호작용에 의해 부과된 구조적 제약은 mTORC1에 의한 4E-BP1 인산화의 계층 구조를 설명합니다. [2]