表現型マイクロアレイとは何ですか？
Phenotype Microarray 表現型マイクロアレイ - We used transcriptomics, Phenotype Microarrays, and a murine model of urinary tract infection to screen for functional consequences due to Type I methylation in three unrelated strains of E. [1] Phenotype microarray (PM) results revealed an improved capacity of BC5 to utilize different carbon sources as compared to BC12, although some specific carbon sources that can be associated to the human diet were only metabolized by BC12, i. [2] Moreover, the changes in LESC phenotype were assessed using of phenotype microarrays. [3] Six rhizobial strains isolated from pea plants were identified as members of the Rhizobium leguminosarum group and phenotypically characterized in depth by Phenotype Microarray (PM). [4] To elucidate the dependence of gene function on the environmental conditions, we focused on quantitative data from a phenotype microarray (PM) of the wild type and ca. [5] Here, phenotype microarray was used to investigate industrial potentials of S. [6] To evaluate carbon and nitrogen source utilization as a measure of competitiveness, we used phenotype microarrays on three endophytes (Trichoderma atroviridae, Trichoderma harzianum and Lecanicillium lecanii) with reported biological control activity and five stem-infecting fungal pathogens (Diplodia seriata, Eutypa lata, Neofusicoccum parvum, Phaeomoniella chlamydospora, and Phaeoacremonium minimum) that infect grapevine and other important woody plant hosts. [7] Moreover, the changes in LESC phenotype were assessed using of phenotype microarrays. [8] 19 under normoxic and hypoxic conditions by observing the cell growth and utilization of metabolites via Phenotype MicroArrays™ under these two different oxygen concentrations. [9] In this study, we have investigated the utility of Phenotype Microarray (PM) plates for identifying collateral sensitivities with unprecedented throughput. [10] To fill this knowledge gap within the field, here we studied the effects of various osmolytes and pH conditions on Escherichia coli persistence with the use of phenotype microarrays and antibiotic tolerance assays. [11] Arginine prevented biofilm formation by reducing FLO11 gene expression; its addition did not affect cell viability and was even found to enhance cell metabolism (vitality marker) as determined by phenotype microarray (PM) analysis. [12] In this study, we have investigated the utility of Phenotype Microarray (PM) plates for identifying collateral sensitivities with unprecedented throughput. [13] Phenotype MicroArrays (PMs) provide a considerable benefit to the evaluation of potential vaccine/drug targets and the assessment of hypothetical protein function. [14] A combination of phenotype microarrays, targeted stress resistance and virulence assays and comparative genome analysis was used to compare a set of Listeria monocytogenes strains including those involved in previous Swiss foodborne listeriosis outbreaks. [15]トランスクリプトミクス、表現型マイクロアレイ、および尿路感染症のマウスモデルを使用して、Eの3つの無関係な系統におけるI型メチル化による機能的結果をスクリーニングしました。 [1] 表現型マイクロアレイ（PM）の結果は、BC12と比較して異なる炭素源を利用するBC5の能力の向上を明らかにしましたが、人間の食事に関連する可能性のある特定の炭素源はBC12によってのみ代謝されました。 [2] さらに、LESC表現型の変化は、表現型マイクロアレイを使用して評価されました。 [3] エンドウ豆植物から分離された6つの根粒菌株は、Rhizobium leguminosarumグループのメンバーとして識別され、表現型は表現型マイクロアレイ（PM）によって詳細に特徴付けられました。 [4] 遺伝子機能の環境条件への依存性を解明するために、野生型と約の表現型マイクロアレイ（PM）からの定量的データに焦点を当てました。 [5] ここでは、表現型マイクロアレイを使用して、Sの産業ポテンシャルを調査しました。 [6] 競争力の尺度として炭素および窒素源の利用を評価するために、生物的防除活性が報告されている3つの内生菌（Trichoderma atroviridae、Trichoderma harzianum、およびLecanicillium lecanii）と5つの幹感染性真菌病原体（Diplodia seriata、Eutypa lata、Neofusiccum）で表現型マイクロアレイを使用しました。ブドウの木や他の重要な木本植物の宿主に感染するparvum、Phaeomoniella chlamydospora、およびPhaeoacremonium minimum）。 [7] さらに、LESC表現型の変化は、表現型マイクロアレイを使用して評価されました。 [8] 19これらの2つの異なる酸素濃度下で、PhenotypeMicroArrays™を介して細胞増殖と代謝物の利用を観察することにより、正常酸素および低酸素条件下で。 [9] この研究では、前例のないスループットで担保感度を識別するための表現型マイクロアレイ (PM) プレートの有用性を調査しました。 [10] フィールド内のこの知識のギャップを埋めるために、ここでは、表現型マイクロアレイと抗生物質耐性アッセイを使用して、大腸菌の持続性に対するさまざまなオスモライトと pH 条件の影響を研究しました。 [11] アルギニンは FLO11 遺伝子発現を減少させることにより、バイオフィルムの形成を防ぎました。その添加は細胞生存率に影響を与えず、表現型マイクロアレイ（PM）分析によって決定されるように、細胞代謝（活力マーカー）を増強することさえ発見されました。 [12] この研究では、前例のないスループットで担保感度を識別するための表現型マイクロアレイ (PM) プレートの有用性を調査しました。 [13] 表現型 MicroArrays (PMs) は、潜在的なワクチン/薬物標的の評価と仮想タンパク質機能の評価に大きな利点を提供します。 [14] 表現型マイクロアレイ、標的ストレス耐性および病原性アッセイ、および比較ゲノム解析の組み合わせを使用して、以前のスイスの食品由来リステリア症アウトブレイクに関与したものを含む一連のリステリア菌株を比較しました。 [15]
Biolog Phenotype Microarray 生物学的表現型マイクロアレイ
The subsequent screening of bacteria by Biolog Phenotype MicroArrays revealed that many of these metabolites provide carbon and energy for the Pseudomonas strains. [1] The subsequent screening of bacteria by Biolog Phenotype MicroArrays revealed that many of these metabolites provide carbon and energy for the Pseudomonas strains. [2] High-throughput differential scanning fluorimetry assays, using Biolog phenotype microarray plates, identified 15 potential ligands for McpTPR, with the majority classified as mono-, di-, and tricarboxylates. [3] We examined Trichoderma longibrachiatum Rifai and Trichoderma bissettii Sandoval-Denis & Guarro strains recovered from four novel cases of human mycoses, along with isolates from previous case reports and different agricultural habitats, using multilocus phylogenetic analysis, BIOLOG Phenotype Microarrays and Etest. [4] The metabolic abilities of the strains were assessed on 758 substrates using Biolog phenotype microarray technology. [5] Using these strains, we analyzed a set of 240 compounds present in Biolog Phenotype Microarrays. [6] We undertook Biolog Phenotype Microarray testing of P. [7] The host utilized 61 of 190 substrates tested using BIOLOG Phenotype MicroArrays. [8] Summary The Biolog Phenotype Microarray (PM) and Anaerobic MicroPlates (AN) 96-well plates utilise colorimetric redox reactions to rapidly screen bacteria for the ability to utilise different carbon sources and other metabolites. [9] Biolog phenotype MicroArray (PM) was adopted to investigate the strain phenotype, with reference to carbon energy utilization and osmotic tolerance. [10] Using these strains, we analyzed a set of 240 compounds present in Biolog phenotype microarrays. [11]その後のBiologPhenotypeMicroArraysによる細菌のスクリーニングにより、これらの代謝物の多くがシュードモナス菌株に炭素とエネルギーを提供することが明らかになりました。 [1] その後のBiologPhenotypeMicroArraysによる細菌のスクリーニングにより、これらの代謝物の多くがシュードモナス菌株に炭素とエネルギーを提供することが明らかになりました。 [2] Biolog表現型マイクロアレイプレートを使用したハイスループットディファレンシャルスキャニング蛍光測定アッセイにより、McpTPRの15の潜在的なリガンドが同定され、その大部分はモノ、ジ、およびトリカルボキシレートに分類されました。 [3] ヒト真菌症の 4 つの新規症例から回収された Trichoderma longibrachiatum Rifai および Trichoderma bissettii Sandoval-Denis & Guarro 株を、以前の症例報告およびさまざまな農業生息地からの分離株とともに、多遺伝子座系統解析、BIOLOG Phenotype Microarrays、および Etest を使用して調べました。 [4] 系統の代謝能力は、Biolog 表現型マイクロ アレイ技術を使用して 758 基板上で評価されました。 [5] これらの菌株を使用して、Biolog Phenotype Microarrays に存在する 240 の化合物のセットを分析しました。 [6] P.の生物学的表現型マイクロアレイ検査を実施しました。 [7] ホストは、BIOLOG Phenotype MicroArrays を使用してテストされた 190 の基質のうち 61 を利用しました。 [8] まとめ Biolog Phenotype Microarray (PM) および Anaerobic MicroPlates (AN) 96 ウェル プレートは、比色レドックス反応を利用して、さまざまな炭素源や他の代謝産物を利用する能力について細菌を迅速にスクリーニングします。 [9] バイオログ表現型 MicroArray (PM) は、炭素エネルギー利用と浸透圧耐性を参照して、ひずみ表現型を調査するために採用されました。 [10] これらの菌株を使用して、Biolog 表現型マイクロ アレイに存在する 240 の化合物のセットを分析しました。 [11]
phenotype microarray assay 表現型マイクロアレイアッセイ
Our metabolomics analysis and phenotype microarray assays further demonstrated that the levels of Krebs cycle molecules are significantly lower in the melanoma persister subpopulation than in the untreated bulk cell population due to increased utilization rates in persisters. [1] Methods: A previously optimized BiologTM Gen III sole carbon utilization phenotype microarray assay protocol for leptospires was adapted. [2] Phenotype microarray assays showed that deletion of srvg17985 led to less use of Gly-Glu as a carbon source but a gain in ability to use l-phenylalanine as a nitrogen source. [3] In addition, in phenotype microarray assays, the Stx2a phage lysogens were characterized by a significant decrease in the cell respiration with gluconeogenic substrates such as amino acids, nucleosides, carboxylic and dicarboxylic acids. [4]私たちのメタボロミクス分析と表現型マイクロアレイアッセイは、クレブス回路分子のレベルが、持続性物質の利用率の増加により、未処理のバルク細胞集団よりも黒色腫持続性細胞集団で有意に低いことをさらに示しました。 [1] 方法：以前に最適化されたBiologTMGenIIIの唯一の炭素利用表現型マイクロアレイアッセイプロトコルをレプトスピラに適合させました。 [2] 表現型マイクロ アレイ アッセイは、srvg17985 の削除により、炭素源としての Gly-Glu の使用が減少するが、l-フェニルアラニンを窒素源として使用する能力が増加することを示しました。 [3] さらに、表現型マイクロアレイアッセイでは、Stx2aファージ溶原菌は、アミノ酸、ヌクレオシド、カルボン酸、ジカルボン酸などの糖新生基質による細胞呼吸の大幅な減少によって特徴付けられました。 [4]
phenotype microarray analysi 表現型マイクロアレイ分析
In order to evaluate the metabolic profile of these vaginal strains, a phenotype microarray analysis was performed on them. [1] This chapter describes the application of OmniLog phenotype microarray analysis, a high-throughput assay for the phenotypic characterization of bacterial strains across a variety of different traits such as nutrient utilization and antimicrobial sensitivity, to Listeria species. [2]これらの膣株の代謝プロファイルを評価するために、表現型マイクロアレイ分析をそれらに対して行った。 [1] この章では、OmniLog表現型マイクロアレイ分析の適用について説明します。これは、栄養素の利用や抗菌薬の感受性など、さまざまな特性にわたる細菌株の表現型の特性を調べるためのハイスループットアッセイです。 [2]